结论：子公司员工犯罪，一般可以在总部所在地报案，但需结合具体情况判断报案地的选择是否合适。

具体分析：

1. 报案地的选择原则：

   • 根据我国《刑事诉讼法》及相关司法解释，刑事案件的报案、控告、举报可以向犯罪地公安机关报案，也可以向犯罪嫌疑人居住地公安机关报案。这里的“犯罪地”包括犯罪行为发生地和犯罪结果发生地。
   • 对于子公司员工犯罪的情况，如果犯罪行为或结果涉及总部所在地（例如，犯罪行为在总部实施，或犯罪结果对总部造成了影响），则总部所在地公安机关具有管辖权，可以在总部报案。

2. 子公司与总部的法律关系：

   • 子公司是具有独立法人资格的实体，其民事责任由子公司自行承担。但是，这并不影响报案地的选择，因为报案地的确定主要基于犯罪行为或结果的发生地，而非公司的法律结构。
   • 如果子公司员工犯罪行为与总部无直接关联（例如，犯罪行为完全发生在子公司所在地，且未对总部造成影响），则更适宜在子公司所在地报案。不过，这并不排除在总部报案的可能性，只是从效率和便利性角度考虑，可能不是最优选择。

3. 实际操作中的建议：

   • 在决定报案地时，应综合考虑犯罪行为的具体情况、证据收集的便利性、公安机关的管辖范围以及后续诉讼的便利性等因素。
   • 如果犯罪行为或结果涉及多个地点，可以选择其中一个具有管辖权的公安机关报案。在这种情况下，总部所在地公安机关可能是一个合适的选择，特别是如果总部在案件调查中能够提供重要线索或证据。
   • 无论选择在哪里报案，都应确保报案内容的真实性和准确性，并配合公安机关的调查工作。

总结：子公司员工犯罪时，可以在总部报案，但需根据犯罪行为或结果的具体情况以及报案地的管辖原则来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。