关于顶楼搭盖如何合法的问题，这确实是一个涉及城乡规划、建筑安全以及法律法规的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，要明确的是，任何在屋顶进行的搭建或加建行为，都必须严格遵守相关的法律法规。根据《中华人民共和国城乡规划法》以及其他相关的地方性法规和规章，进行建筑物、构筑物的建设，必须事先向城市、县人民政府城乡规划主管部门申请办理建设工程规划许可证。这是确保建设活动合法、有序进行的基本前提。
对于您提到的“之前建房子只建了两层，现在家里人口多，可以在楼顶加建一层吗？”的问题，答案是否定的。除非您已经按照法定程序，向相关部门申请并获得了建设工程规划许可证，否则任何在楼顶进行的加建行为都是违法的。这是因为，楼顶加建不仅可能影响到房屋的整体结构安全，还可能对周边环境、城市形象等产生不良影响。
那么，如何合法地进行顶楼搭盖呢？以下是一些建议：
了解相关法律法规：在决定进行顶楼搭盖之前，务必详细了解并遵守《中华人民共和国城乡规划法》、《城市容貌标准》、《建筑防火通用规范》等相关法律法规和规章。
申请建设工程规划许可证：向城市、县人民政府城乡规划主管部门提交申请，说明搭盖的目的、规模、结构等详细信息，并等待审批结果。只有获得许可证后，才能进行搭盖。
确保施工质量和安全：在搭盖过程中，必须严格按照设计图纸和施工规范进行施工，确保施工质量和安全。同时，要遵守相关的环保和消防规定，确保搭盖活动不会对周边环境和居民生活造成不良影响。
接受监管和检查：在搭盖完成后，要接受相关部门的监管和检查。如果发现存在违法违规行为，必须立即整改并接受相应的处罚。
总之，顶楼搭盖必须合法合规进行。只有在遵守相关法律法规和规章的前提下，才能确保搭盖活动的合法性和安全性。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地的城乡规划主管部门或相关法律机构。