物业公司未经业主大会通过入驻小区是不合法的。以下从法律依据、业主自治权、合同相对性及法律后果几个方面进行详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》第二百七十八条：
- 该条款明确规定了业主共同决定的事项，包括选聘和解聘物业服务企业或者其他管理人。决定此类事项，应当经参与表决专有部分面积四分之三以上的业主且参与表决人数四分之三以上的业主同意。
《物业管理条例》第十一条和第十二条：
- 条例中明确指出，选聘和解聘物业服务企业应由业主共同决定。业主大会会议可以采用集体讨论或书面征求意见的形式，但必须有物业管理区域内专有部分占建筑物总面积过半数的业主且占总人数过半数的业主参加。对于筹集和使用专项维修资金、改建或重建建筑物及其附属设施等重大事项，必须经专有部分占建筑物总面积三分之二以上的业主且占总人数三分之二以上的业主同意。
二、业主自治权
- 业主对小区内的公共事务享有自治权，这包括选择物业服务企业的权利。未经业主同意，任何组织或个人不得擅自入驻小区提供服务。这是业主作为小区共有部分和共同管理权利人的基本权益。
三、合同相对性
- 如果物业公司想要入驻小区，必须与业主或业主委员会签订物业服务合同。没有合法有效的合同作为依据，其入驻行为就是违法的。合同的相对性原则要求，合同双方必须基于自愿、平等、公平的原则签订合同，任何一方不得擅自变更或解除合同。
四、可能的法律后果
- 如果物业公司未经业主同意擅自入驻小区，可能面临被业主拒绝、要求撤离的法律后果。同时，如果其行为给业主造成了损失，如破坏了小区的公共设施、影响了业主的正常生活等，物业公司还可能承担赔偿责任。
五、建议措施
加强沟通协商：
- 物业公司在入驻小区前，应与业主或业主委员会进行充分沟通协商，了解业主的需求和意见，争取得到业主的支持和同意。这有助于建立和谐的物业关系，减少后续的纠纷和矛盾。
遵守法律法规：
- 物业公司应严格遵守相关法律法规的规定，确保入驻行为的合法性。不得采取欺骗、胁迫等手段强迫业主接受服务。否则，将面临法律制裁和声誉损失。
建立监督机制：
- 建立健全的监督机制，对物业公司的服务质量进行监督和管理。如果发现物业公司存在违法行为或服务质量问题，业主或业主委员会应及时采取措施予以纠正，如要求物业公司整改、解除合同等。
总结来看，物业公司未经业主大会通过入驻小区是不合法的。业主作为小区的主人，享有选择物业服务企业的权利。物业公司应尊重业主的自治权，遵守相关法律法规，与业主建立和谐的物业关系。如果业主在物业纠纷方面遇到问题，可以直接向我咨询，我将提供专业的法律建议。