当共同申请执行人有不同意见时，可以采取以下措施来处理：
内部协商与沟通：
- 核心要点：共同申请执行人之间应首先尝试通过内部协商和沟通来解决分歧。这包括召开会议、讨论各自的观点和利益诉求，并寻求共识。
- 法律依据：虽然具体的法律条款可能并未直接规定共同申请执行人必须协商，但根据民事诉讼的协作原则和效率原则，当事人之间应尽可能通过协商来解决问题，以减少诉讼成本和时间。
- 建议：在协商过程中，可以邀请中立的第三方（如律师或调解员）参与，以帮助双方更客观地看待问题，并找到合理的解决方案。
按照多数意见执行，并保障少数意见者权益：
- 核心要点：如果共同申请执行人之间无法达成一致意见，可以按照多数人的意见来执行申请。但同时，应确保少数意见者的合法权益不受损害，例如通过书面记录他们的意见，并在执行过程中给予适当的考虑。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，共同诉讼人之间在诉讼中的行为一般对其他共同诉讼人发生效力，但当事人可以在诉讼中明确表示放弃或变更自己的诉讼请求，这同样适用于执行阶段。
- 建议：在执行过程中，如果多数意见的执行可能对少数意见者造成不利影响，应提前与少数意见者沟通，并尽可能通过调整执行方案来减少这种影响。
通过法律程序解决分歧：
- 核心要点：如果共同申请执行人之间的分歧无法通过协商解决，且可能影响到执行的顺利进行，可以考虑通过法律程序（如申请法院裁定或提起诉讼）来解决分歧。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对执行行为有异议的，可以向执行法院提出书面异议。法院将依法进行审查，并作出裁定。
- 建议：在提起法律程序前，应充分评估分歧的性质和可能的影响，以及通过法律程序解决分歧的成本和效率。同时，应准备好相关的证据材料，以支持自己的主张。
寻求专业法律帮助：
- 核心要点：如果共同申请执行人之间的分歧复杂且难以解决，建议寻求专业的法律帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼或调解等服务，帮助当事人更有效地解决分歧。
- 法律依据：律师作为专业的法律服务提供者，其职责包括为当事人提供法律咨询、代理诉讼等。根据《中华人民共和国律师法》的相关规定，律师有权接受当事人的委托，为其提供法律服务。
- 建议：在选择律师时，应考虑其专业领域、经验和信誉等因素。同时，应与律师充分沟通，明确自己的需求和期望，以便律师能够提供更有针对性的法律服务。
在处理共同申请执行人之间的分歧时，应优先考虑通过协商和沟通来解决。如果无法达成一致意见，可以按照多数意见执行，并保障少数意见者的权益。如果分歧复杂且难以解决，建议寻求专业的法律帮助。在整个过程中，应遵守法律法规和诉讼程序，确保执行的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。