关于违法占地跨越新旧法按照新法罚款的法院判决案例，目前没有直接公开的、完全对应这一情形的完整法院判决文书可供直接引用，但可以通过一个类似案例的分析来理解相关法律适用原则。
案例分析：XX市XX有限责任公司非法占地案
案情简介：
XX市XX有限责任公司于2020年7月以来，未经依法批准在XX市XX区XX乡XX村二组，占用集体土地1197平方米修建钢架厂房。该行为被自然资源部门通过卫片发现，并进行了立案查处。
法律适用与处罚：
违法事实认定：
- XX市XX有限责任公司未经依法批准占用集体土地修建钢架棚，属于非法占地，违反了《中华人民共和国土地管理法》的相关规定。
新旧法适用问题：
- 本案发生时间是2020年7月，而新版《中华人民共和国土地管理法》的实施时间是2020年1月1日，对法律责任这块的自由裁量权没有具体的规定。《中华人民共和国土地管理法实施条例》的实施时间则是2021年9月1日。
- 根据“法不溯及既往”的原则，即新法不应对其生效前的行为产生法律效力，因此本案在处罚时依据了行为发生时有效的（原）《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四十二条。
处罚决定：
- XX区自然资源局对XX市XX有限责任公司的违法行为作出了包括退还非法占用的土地、没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、并处罚款人民币23940元（乔木林地、设施农用地按20元/平方米）的处罚决定。
- 罚款标准依据了（原）《湖南省国土资源处罚裁量权基准》的相关规定，对符合土地利用规划的，可以并处以非法占用土地每平方米15元以上25元以下的罚款。
法律背景与建议
法律背景：
- 在处理违法占地案件时，若行为跨越新旧法实施时间，通常遵循“法不溯及既往”的原则，即依据行为发生时有效的法律进行处罚。
- 同时，也会考虑新法的精神，如优化营商环境、助推乡村振兴等政策导向，在处罚时予以适当考量。
法律建议：
- 对于违法占地行为，建议及时咨询专业律师，了解具体法律适用和处罚标准。
- 若行为已发生且面临处罚，应积极配合整改，争取从轻或减轻处罚。
- 在未来进行土地利用时，应严格遵守相关法律法规，确保合法合规。
可能的法律后果
- 若违法占地行为未得到及时纠正，可能面临更严厉的处罚，包括更高的罚款、强制拆除违法建筑等。
- 违法占地行为还可能影响企业的信誉和后续发展，因此建议企业高度重视土地利用合规问题。
虽然无法直接提供一个完全对应“违法占地跨越新旧法按照新法罚款”的法院判决案例，但通过上述案例分析，可以理解到在处理此类案件时，法律适用和处罚决定是如何进行的。如有任何具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。