部队招投标被质疑时，应当依法依规、积极稳妥地处理，以确保招投标活动的公正、公平和顺利进行。以下是从不同角度给出的处理建议：
一、理解质疑内容与来源
核实质疑主体资格：
- 根据军队采购相关规定，质疑投诉实行实名制。供应商参与所质疑项目采购活动后，方具备质疑资格。以联合体形式参加军队采购活动的，质疑投诉应由组成联合体的所有供应商共同提出。
- 核实质疑人是否具备质疑资格，避免无效质疑的干扰。
分析质疑内容：
- 质疑可能涉及采购文件、采购过程、中标（成交）结果等多个方面。
- 仔细分析质疑内容，明确质疑的具体事项和请求，以及事实依据和法律依据。
二、依法依规处理质疑
及时受理与答复：
- 代理机构应当指定部门或者专人负责质疑受理和答复工作，不得拒收符合规定的质疑。
- 在规定期限内，以书面形式对质疑进行答复，并附必要的证明材料。
分类处理质疑：
- 对采购文件的质疑：在规定期限内（如对资格预审文件提出质疑的，在提交资格预审申请文件截止时间2日前提出；对招标文件提出质疑的，在投标截止时间10日前提出）提出，并附必要的证明材料。
- 对采购过程的质疑：在各采购程序环节结束之日起3日内提出，但是对开标的质疑需在现场提出。在规定质疑期内，应当一次性提出针对同一采购程序环节的质疑。
- 对采购结果的质疑：在中标（成交）结果公示期内提出，要有充分的事实根据及法规依据。
组织复核与调查：
- 对于质疑事项，代理机构可以组织相关人员进行复核和调查，包括向被质疑供应商发出询问函、向有关部门调查核实等。
- 必要时，可以组织原评审委员会协助处理答复质疑。
三、预防与治理恶意质疑
提高采购需求与文件的规范性：
- 严格按照相关法规要求，规范军队物资服务集中采购需求管理，提高采购质量和效率。
- 正确编制采购文件，减少人为因素，防止“量身定制”等不公平现象。
严密组织现场评审：
- 严格要求现场纪律，依法独立评审，确保评审的公正性和客观性。
- 对评审情况进行复核，解决个别专家对投标文件区别对待等问题。
严厉打击恶意质疑：
- 提高质疑过错方的成本，按照“谁过错、谁负担”的原则，对处理质疑发生的鉴定费、专家论证费等全部由过错方承担。
- 加强信用体系建设，强化与相关领域的失信联合惩戒机制，让恶意质疑失信者“一处失信、处处受限”。
四、法律后果与应对策略
法律后果：
- 如果质疑成立，可能会影响中标结果，甚至导致重新招标。
- 如果质疑不成立，质疑人可能需要承担相应的法律责任，如赔偿因质疑给采购人造成的损失等。
应对策略：
- 积极与质疑人沟通协商，寻求快速解决争议的途径。
- 如果质疑人无理取闹或恶意质疑，可以依法向有关部门投诉或寻求法律救济。
举例说明：假设某部队在招投标过程中，收到一家供应商对中标结果的质疑，认为中标供应商的技术参数不符合招标文件要求。此时，部队应首先核实质疑人的资格和质疑内容，然后组织相关人员进行复核和调查。如果复核结果显示中标供应商确实存在问题，部队应依法处理，如取消中标资格并重新招标；如果复核结果显示质疑不成立，部队应书面答复质疑人，并说明理由。
特别提醒：在处理部队招投标质疑时，务必遵循相关法律法规和军队采购规定，确保处理过程的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。