针对公司男员工打女员工这一严重问题，我们需要从法律、公司规章制度以及实际操作三个层面来详细分析和处理。

一、法律层面

首先，从法律角度来看，任何形式的暴力行为，包括职场中的打人行为，都是违法的。根据《中华人民共和国劳动法》以及《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，用人单位有义务保护女职工的合法权益，不得对其实施任何形式的暴力或歧视。如果男员工对女员工实施了暴力行为，这不仅违反了公司规章制度，更触犯了法律。

在这种情况下，女员工有权向公安机关报案，并要求对施暴者进行法律制裁。同时，根据《劳动保障监察条例》，用人单位如果违反了对女职工的保护规定，侵害了其合法权益，将由劳动行政部门责令改正，并可能处以罚款。

二、公司规章制度层面

其次，从公司规章制度的角度来看，大多数公司都会明确规定禁止任何形式的职场暴力行为，包括打人、辱骂等。如果男员工违反了这一规定，公司有权根据规章制度对其进行相应的处罚，包括但不限于警告、罚款、降职、解雇等。

在处理此类事件时，公司应迅速启动内部调查程序，收集相关证据，如监控录像、证人证言等，以确保处理结果的公正性和准确性。同时，公司还应为受害者提供必要的支持和帮助，如心理辅导、法律援助等。

三、实际操作层面

在实际操作中，当发生男员工打女员工的事件时，公司应立即采取以下措施：

1. 确保受害者安全：首先确保女员工的人身安全，避免其受到进一步的伤害。
2. 启动内部调查：迅速成立调查小组，对事件进行全面、客观的调查。
3. 收集证据：收集相关证据，包括监控录像、证人证言、医疗记录等。
4. 根据规章制度处理：根据调查结果和公司规章制度，对施暴者进行相应的处罚。
5. 提供支持和帮助：为受害者提供必要的支持和帮助，如心理辅导、法律援助等，并协助其处理相关事宜。
6. 加强预防和教育：通过培训、宣传等方式，加强员工对职场暴力的认识和防范意识，营造和谐、安全的职场环境。

综上所述，处理公司男员工打女员工的问题需要从法律、公司规章制度以及实际操作三个层面进行综合考虑和处理。公司应坚决维护女职工的合法权益，对施暴者进行严肃处理，并加强预防和教育，以营造和谐、安全的职场环境。