法定节假日员工同意调休，不算加班工资的做法，在一般情况下是无效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律对法定节假日加班的规定
根据《劳动法》第四十四条的规定，用人单位在法定休假日安排劳动者工作的，应当支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这一规定明确了法定节假日加班必须支付加班费，且不得以调休替代。这是因为法定节假日具有特殊性，是劳动者依法享有的休息权利，用人单位安排劳动者在法定节假日工作，实际上剥夺了劳动者的休息权，因此应当通过支付加班费的方式进行补偿。
二、员工同意调休的情况分析
员工自愿选择调休：
- 如果员工在法定节假日加班后，自愿选择调休而非要求支付加班费，且调休已经完成，那么员工再主张加班费可能会面临法律上的困难。因为此时可以视为员工已经通过调休的方式接受了补偿。
- 但需要注意的是，这种自愿选择调休的行为应当是员工真实意思的表示，且不得存在用人单位强迫或诱导的情况。
用人单位强制调休：
- 如果用人单位在法定节假日安排员工加班后，强制要求员工调休而不支付加班费，那么这种做法是违法的。因为根据法律规定，法定节假日加班必须支付加班费，用人单位无权单方面决定以调休替代。
三、法律建议与维权途径
保留证据：
- 劳动者在法定节假日加班时，应当保留好相关证据，如考勤记录、加班通知、工作成果等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
与用人单位协商：
- 如果用人单位在法定节假日安排加班后未支付加班费，劳动者可以先与用人单位进行协商，要求支付应得的加班费。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁：
- 如果投诉仍未得到解决，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、实际案例与法律后果
- 实际案例中，已有劳动者因用人单位在法定节假日安排加班未支付加班费而提起劳动仲裁或诉讼，并最终获得胜诉的案例。这些案例表明，用人单位在法定节假日安排加班必须支付加班费是法律规定的义务，不得以调休替代。
- 如果用人单位违反法律规定，在法定节假日安排加班未支付加班费，将可能面临劳动监察部门的处罚以及劳动者的法律诉讼，从而承担不必要的法律风险和经济损失。
总结来看，法定节假日员工同意调休不算加班工资的做法在一般情况下是无效的。用人单位在法定节假日安排员工加班必须支付加班费，这是法律规定的义务。如果用人单位违反这一规定，劳动者有权通过法律途径维护自己的合法权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。