药店销售炮山甲40克是否违法，需结合具体情况判断，但通常情况下，未经批准销售无专用标识的炮山甲属于违法行为。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国野生动物保护法》的相关规定，出售、购买、利用、运输、携带、寄递国家重点保护野生动物及其制品，必须取得相应的批准文件、专用标识或许可证。炮山甲作为由穿山甲鳞片炮制而成的中药材，其原料穿山甲属于国家重点保护野生动物。因此，销售炮山甲必须严格遵守相关法律法规。
二、违法情形分析
无专用标识销售：
- 若药店销售的炮山甲未取得中国野生动物经营利用管理专用标识，则属于违法行为。根据《野生动物保护法》第五十二条，此类行为将由县级以上人民政府野生动物保护主管部门和市场监督管理部门按照职责分工没收野生动物及其制品和违法所得，并处野生动物及其制品价值二倍以上二十倍以下罚款；情节严重的，还将面临吊销人工繁育许可证、撤销批准文件、收回专用标识等处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
未取得批准文件或许可证：
- 即使炮山甲有专用标识，但若药店未取得相应的批准文件或许可证就进行销售，同样构成违法。此类行为也将受到法律的严厉制裁。
三、实际案例与后果
- 已有实际案例表明，药店因违法销售炮山甲而受到法律处罚。例如，重庆市江津区人民法院宣判的一起危害珍贵、濒危野生动物案件中，药店老板袁某因非法购买并销售炮山甲而被判处有期徒刑三年，缓刑三年，并处罚金10000元。
- 四川宜宾翠屏区法院也受理了类似案件，药房负责人熊某因非法出售国家I级重点保护珍贵野生动物制品（炮山甲）而被判处有期徒刑6个月，缓刑1年，并处罚金人民币2000元。
四、法律建议与风险提示
合规经营：
- 药店在销售中药材时，应严格遵守相关法律法规，确保所售药材来源合法、手续齐全。对于炮山甲等涉及国家重点保护野生动物的中药材，更应谨慎对待，避免因违法销售而承担法律责任。
加强内部管理：
- 药店应建立健全内部管理制度，加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识。同时，应定期对库存药材进行自查自纠，确保无违法销售行为发生。
及时咨询与应对：
- 若药店对炮山甲等中药材的销售存在疑问或不确定是否合法，应及时咨询专业律师或相关主管部门以获取准确指导。在面临法律处罚时，也应积极配合调查和处理工作，以减轻或避免法律责任。
综上所述，药店销售炮山甲40克是否违法需结合具体情况判断，但通常情况下未经批准销售无专用标识的炮山甲属于违法行为。药店应严格遵守相关法律法规，确保合规经营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。