可以起诉。即便离婚时约定两个孩子归女方抚养且抚养费由女方承担，后续若出现特定情形，仍可通过法律途径解决相关问题，以下从不同角度为你详细分析：
变更抚养权诉讼
若存在法定情形，另一方（如男方）有权向法院提起变更抚养关系诉讼，要求变更孩子的抚养权。具体法定情形如下：
- 女方患严重疾病或伤残无力抚养：如果女方因患严重疾病或因伤残导致无力继续抚养子女，男方可以提出变更抚养权。例如，女方突发重大疾病，丧失劳动能力，无法为孩子提供基本的生活保障和照顾。
- 女方不尽抚养义务或有虐待子女行为：当女方不尽抚养义务，如长期不关心孩子的生活、教育，或者有虐待子女的行为，对子女的身心健康造成不利影响时，男方有权起诉变更抚养权。比如，女方经常将孩子独自留在家中，不提供必要的饮食和生活照顾，甚至对孩子进行打骂。
- 女方与子女共同生活对子女身心健康不利：若女方与子女共同生活，对子女的身心健康存在明显的不利影响，如女方有不良嗜好（酗酒、赌博等），或者生活环境恶劣，不利于孩子的成长，男方可以提起诉讼。
- 八周岁以上子女愿随另一方生活且该方有抚养能力：对于八周岁以上的未成年子女，如果他们愿意随另一方（如男方）生活，并且该方具有抚养能力，法院一般会支持变更抚养权。例如，孩子明确表示希望和父亲一起生活，父亲也有稳定的工作和住所，能够为孩子提供良好的生活条件。
起诉流程：
- 收集证据：男方需要收集能够证明存在上述法定情形的证据，如医院的诊断证明、邻居或老师的证人证言、照片或视频等。
- 撰写起诉状：根据收集到的证据，撰写起诉状，详细说明要求变更抚养权的理由和事实依据，并提出具体的诉讼请求。
- 向法院提起诉讼：将起诉状提交给有管辖权的法院，并按照法院的要求缴纳诉讼费用。法院受理案件后，会向女方发出传票，通知其出庭应诉。
- 出庭应诉：在庭审过程中，男方需要向法院提供充分的证据证明存在变更抚养权的正当理由，女方也可以提出抗辩并提供证据。法院将根据双方提供的证据和陈述进行审理。
- 等待判决结果：法院在审理结束后会作出判决，如果判决支持变更抚养权，女方需要按照判决履行相关义务。
抚养费相关诉讼
虽然离婚时约定抚养费由女方承担，但在某些情况下，子女或女方仍可以起诉要求另一方（如男方）支付抚养费。
- 子女在必要时提出合理要求：根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十五条规定，前款规定的协议或者判决，不妨碍子女在必要时向父母任何一方提出超过协议或者判决原定数额的合理要求。例如，随着孩子年龄的增长，教育费用、医疗费用等大幅增加，原有的抚养费无法满足孩子的实际需求，子女可以向法院起诉要求男方增加抚养费。
- 女方因特殊情况无力承担抚养费：如果女方因失业、重大疾病等原因导致经济困难，无力继续承担抚养费，可以与男方协商解决。若协商不成，女方也可以代表子女向法院起诉，要求男方支付部分或全部抚养费。
起诉流程：
- 收集证据：收集能够证明子女实际需求增加或女方经济困难的证据，如学校的收费通知、医院的诊断证明和费用清单、女方的失业证明等。
- 撰写起诉状：根据收集到的证据，撰写起诉状，明确诉讼请求和事实理由。
- 向法院提起诉讼：将起诉状提交给有管辖权的法院，并缴纳诉讼费用。
- 出庭应诉：在庭审过程中，提供证据支持自己的诉讼请求，男方也可以进行答辩和提供证据。
- 等待判决结果：法院会根据双方提供的证据和法律规定作出判决。
总之，离婚后关于孩子抚养的问题并非一成不变，若出现上述法定情形，可以通过法律途径维护自己和孩子的合法权益。如果你还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。