您好，关于您提出的“社保缴费基数比实际薪资低是否合法”的问题，这是一个涉及劳动法规和社保政策的重要问题，我将为您详细解答。

首先，根据《关于规范社会保险缴费基数有关问题的通知》的规定，职工的社保缴费基数一般是按照职工上一年度月平均工资（或个人上月工资）来确定的。这意味着，理论上，职工的社保缴费基数应该与其实际薪资相匹配，薪资越高，社保缴费基数也会相应越高。

然而，该通知也同时设置了缴费基数的上限和下限。具体来说，如果缴费基数低于各地规定的最低缴费基数（通常是当地社平工资的60%），那么就应该按照最低缴费基数来缴纳社保；反之，如果缴费基数高于各地规定的最高缴费基数（通常是当地社平工资的300%），则应该按照最高缴费基数来缴纳。但这里需要明确的是，最低工资标准并不等同于社保缴费基数，按照最低工资标准来缴纳社保是不合法的。

在实际操作中，如果公司按照低于职工实际薪资但高于最低缴费基数的标准来缴纳社保，虽然不完全符合“按实际薪资缴纳”的原则，但并不直接构成违法，因为这可能是在遵循当地规定的缴费基数范围内进行的操作。然而，如果公司故意将社保缴费基数设定得低于职工的实际薪资，且低于当地规定的最低缴费基数，那么这种行为就是违法的。

此外，从劳动者的权益保护角度来看，如果因为公司未依法缴纳社会保险费（包括缴费基数不符合法律规定）而导致劳动者权益受损，劳动者有权要求公司进行补缴，并在一定条件下（如公司未在规定时间内补缴）提出解除劳动合同并要求公司支付经济补偿。这一点在多个地方的劳动争议案件审理指南或相关通知中都有明确体现。

综上所述，社保缴费基数比实际薪资低并不一定合法，这取决于具体的缴费基数是否符合当地的规定。如果缴费基数低于当地规定的最低缴费基数，那么这种行为就是违法的。因此，建议您在遇到类似情况时，先了解清楚当地的社保政策和规定，再与公司进行沟通协商，必要时可以寻求法律援助或向相关部门投诉举报。