物业总公司有营业执照而小区没有营业执照，这一情况本身并不直接构成违法，但需结合具体情形和法律规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 物业总公司与小区分支机构的法律关系

• 物业总公司作为独立法人，持有营业执照是其合法经营的基础。若小区作为物业总公司的分支机构（如分公司），根据《公司法》及相关规定，分支机构本身不具有独立法人资格，通常无需单独办理营业执照，但需在总公司授权范围内开展业务，并接受总公司的管理和监督。
• 若小区作为分支机构未办理营业执照但合法经营：这种情况下，小区的物业管理活动由总公司负责，小区本身不独立承担法律责任，因此未办理营业执照不构成违法。但需确保小区的物业管理活动符合总公司营业执照范围内的业务，且已按规定进行备案或登记（如需）。

2. 小区独立经营但未办理营业执照的情形

• 若小区试图以独立主体身份从事物业管理活动，却未办理营业执照，则可能构成违法。根据《公司法》和《企业法人登记管理条例》，未经登记注册以企业名义从事经营活动的，属于无照经营，可能面临行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
• 法律后果：无照经营不仅违反了市场准入规则，还可能损害业主权益，如无法提供正规发票、缺乏监管导致服务质量下降等。此外，一旦发生纠纷，小区可能因无照经营而承担更重的法律责任。

3. 物业管理活动的合法性要求

• 无论小区是否办理营业执照，其物业管理活动均需符合相关法律法规要求，如《物业管理条例》等。这包括但不限于：与业主签订规范的物业服务合同、按照合同约定提供服务、公开服务内容和收费标准、接受业主和业主委员会的监督等。
• 合规建议：即使小区作为分支机构无需单独办理营业执照，也应确保物业管理活动的合规性，如定期向业主公示财务状况、服务记录等，以维护业主权益和小区秩序。

4. 特殊情况下的处理

• 若小区因历史原因或特殊情况未办理营业执照，但已实际从事物业管理活动多年且未引发纠纷，建议尽快补办相关手续或明确与总公司的法律关系，以避免潜在的法律风险。
• 操作步骤：可咨询当地工商行政管理部门或物业管理部门，了解补办营业执照的具体流程和要求；同时，与总公司协商明确小区的法律地位和责任划分。

总结与建议：

• 物业总公司有营业执照而小区没有，是否违法需结合小区的法律地位和经营方式来判断。
• 若小区作为分支机构合法经营，则无需单独办理营业执照；但若试图独立经营却未办理，则可能构成无照经营。
• 无论何种情况，均应确保物业管理活动的合规性，以维护业主权益和小区秩序。
• 如有疑问或需要进一步帮助，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供法律建议。