公司以不能胜任岗位为由辞退员工，在符合法定程序的情况下需要支付经济补偿金；若违法辞退，则需支付赔偿金。以下是对此问题的详细分析：

一、符合法定程序的情况

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，当员工不能胜任工作时，单位不能直接辞退。而是要先对员工进行培训或者调整工作岗位。若经过这些举措后，员工仍不能胜任工作，单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付一个月工资后，方可解除劳动合同。此时，单位需按照劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准给付经济补偿金。例如，员工在单位工作了3年，那么单位在合法辞退时应支付3个月工资的经济补偿金。

二、违法辞退的情况

若用人单位跳过培训或调岗环节，直接以不能胜任为由辞退员工，此行为属于违法解除劳动合同。在这种情况下，用人单位需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。继续以工作3年的员工为例，若单位违法辞退，则需支付6个月工资的赔偿金。

三、经济补偿金与赔偿金的计算标准

1. 经济补偿金：按劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

2. 赔偿金：若用人单位违法解除劳动合同，需按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。

四、建议与注意事项

• 保留证据：无论是员工还是用人单位，在涉及此类纠纷时，都应保留好相关证据，如培训记录、调岗通知、工资单等，以备不时之需。
• 遵循法定程序：用人单位在辞退员工时，务必遵循法定程序，否则可能面临支付赔偿金的风险。
• 及时咨询：若对此类问题有疑问或面临相关纠纷，建议及时向我咨询，以便获得更专业的法律建议。

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