若双方第一次起诉离婚时均同意离婚，但对抚养权意见不一致，法院会根据子女的年龄、双方抚养条件及最有利于未成年子女的原则进行判决。具体分析如下：

一、子女年龄对抚养权判决的影响

1. 不满两周岁的子女：

   • 原则上由母亲直接抚养。这是基于婴幼儿对母亲的依赖以及母亲通常能提供更为细致的照料。
   • 但若母亲有不适宜抚养的情况，如患有严重疾病、未尽抚养义务等，抚养权也可以判给父方。

2. 已满两周岁的子女：

   • 若父母双方对抚养问题不能达成协议，人民法院将根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则进行判决。
   • 法院会综合考虑父母双方的经济状况、居住条件、教育程度以及对孩子的关爱程度等因素，以确保孩子的最佳利益。
   • 若一方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力，或者该方无其他子女而另一方有其他子女，这些情形在判决时会被优先考虑。

3. 已满八周岁的子女：

   • 法院在判决抚养权时，会尊重孩子的真实意愿。这是因为八周岁以上的孩子已经有了一定的判断能力和自主意识，他们的意愿应当得到尊重。

二、双方抚养条件对抚养权判决的影响

• 法院在判决抚养权时，会详细审查双方提供的证据，如经济收入、居住条件、教育背景、陪伴孩子时间等。
• 这些证据将帮助法院判定哪一方更适宜抚养孩子，从而作出抚养权归属的判决。

三、法律程序与建议

1. 协商阶段：

   • 在起诉前，双方可以尝试协商确定抚养权归属。协商时，应综合考虑孩子年龄、双方抚养能力和条件、孩子生活环境等因素，以孩子利益最大化为原则。

2. 诉讼阶段：

   • 若协商无果，可向法院提起离婚诉讼，并明确提出抚养权争议。
   • 在诉讼过程中，双方应积极提供证据证明自己抚养子女的优势，以争取抚养权。
   • 法院将依法进行审理，并作出公正判决。

3. 后续事项：

   • 无论抚养权归哪一方，未直接抚养孩子的一方都享有探视权。双方应协商确定合理的探视频率和方式，以维系孩子与非抚养方的情感。
   • 随着孩子成长，若出现影响抚养权的重大情况（如一方经济状况恶化、孩子意愿改变等），双方可以协商变更抚养权，或向法院提起诉讼请求变更。

建议：在处理此类纠纷时，双方应保持冷静和理性，以孩子的最佳利益为出发点进行协商和诉讼。如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。