行政事业单位借入贷款，主要违反了预算管理、财务规则及专项资金管理等相关规定，具体分析如下：

1. 违反预算管理规定
   根据《中华人民共和国预算法》及相关实施条例，行政事业单位的预算需遵循“量入为出、收支平衡”原则，不得编制赤字预算。若单位通过借入贷款弥补预算缺口，实质上突破了预算约束，可能导致财政资金使用失控，影响公共财政的可持续性。例如，某单位未经批准擅自借款用于日常运营，可能被认定为“违规举债”，面临财政部门责令整改、扣减预算等处罚。

2. 违反财务规则与内部控制要求
   《行政单位财务规则》及《事业单位财务规则》明确规定，单位应严格控制对外借款，确需借款的需经主管部门或财政部门审批，并纳入预算管理。若单位未履行审批程序或未将借款纳入预算，可能构成“违规举债”或“账外负债”，违反财务透明度原则。此外，根据《行政事业单位内部控制规范（试行）》，单位需建立债务风险防控机制，擅自借款可能暴露内部控制缺陷，引发审计风险。

3. 违反专项资金管理规定
   若借款资金用于专项项目（如基建、科研等），需符合专项资金管理要求。例如，根据《基本建设财务规则》，基建项目资金应专款专用，不得通过借款挪用其他资金。若单位以借款名义套取专项资金，可能涉嫌“截留、挪用财政资金”，需承担行政责任甚至刑事责任。

4. 地方隐性债务风险
   若行政事业单位（尤其是地方政府融资平台）通过借款形成政府性债务，可能违反《关于加强地方政府性债务管理的意见》（国发〔2014〕43号），该文件明确禁止地方政府违规举债，要求债务纳入预算管理。此类行为可能被认定为“新增隐性债务”，相关责任人可能面临问责，包括纪律处分、行政处罚等。

实务建议：
行政事业单位若确有借款需求，应严格履行以下程序：

• 向主管部门或财政部门提交借款申请，说明资金用途、还款来源及风险评估；
  
• 将借款纳入年度预算或中期财政规划，确保资金使用合规；
  
• 建立债务台账，定期向财政部门报告债务情况，防范债务风险。
  

如有具体案例或操作疑问，可直接向我咨询，我将结合法规与实务提供针对性分析。