核心结论：机动车在等红灯时占用非机动车道发生交通事故，责任认定需结合具体情形，通常涉及机动车违法占用非机动车道的过错，以及非机动车或行人是否存在过错。以下是具体分析：

1. 机动车违法占用非机动车道的责任

根据《道路交通安全法》第三十六条，机动车、非机动车、行人应分道通行。机动车占用非机动车道等红灯，属于“违法占用非机动车道”的行为，违反了分道通行原则。

• 若事故由机动车引发（如突然起步、未观察路况导致与非机动车碰撞）：机动车通常承担主要或全部责任，因其违法占用非机动车道在先，且未尽到安全注意义务。
  
• 若非机动车或行人存在过错（如非机动车逆行、超速，或行人突然横穿）：责任可能按过错比例分担。例如，机动车承担70%责任，非机动车承担30%。

2. 事故责任认定的关键因素

交警部门在认定责任时，会综合以下因素：

• 现场证据：监控录像、行车记录仪、证人证言等，证明机动车是否违法占用非机动车道，以及事故发生的具体经过。
  
• 过错程度：机动车是否因违法占用非机动车道导致事故风险增加；非机动车或行人是否违反交通规则（如闯红灯、逆行）。
  
• 因果关系：机动车的违法行为与事故发生是否存在直接因果关系。例如，若机动车正常等待红灯，非机动车因自身原因撞上，责任可能不同。

3. 特殊情形：非机动车道被占用时的处理

若非机动车道因施工、障碍物等原因无法通行，机动车临时借用非机动车道需谨慎：

• 应减速慢行，并确保不影响非机动车通行。
  
• 若发生事故，仍可能因“未确保安全”承担部分责任，但责任比例可能低于故意违法占用。

4. 法律后果与建议

• 行政处罚：机动车违法占用非机动车道，可能面临罚款、扣分等处罚。
  
• 民事赔偿：根据责任比例，机动车方需赔偿非机动车或行人的损失（如医疗费、财产损失）。
  
• 建议：发生事故后，立即报警并保护现场，配合调查。若对责任认定有异议，可在收到《道路交通事故责任认定书》后3日内申请复核。

总结：机动车等红灯时占用非机动车道发生事故，责任认定需结合违法事实、过错比例及因果关系。若您遇到类似情况，可直接向我咨询具体细节，我会结合证据为您分析责任划分及维权策略。