在台风导致无法上班的情况下，老板扣工资通常是不合法的，但具体需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律规定与原则
不可抗力因素：
- 台风属于不可抗力因素，即不能预见、不能避免且不能克服的客观情况。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十条，因不可抗力不能履行民事义务的，不承担民事责任。这一原则同样适用于劳动关系，即员工因不可抗力无法上班时，不应承担因此产生的责任。
工资支付规定：
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有合法依据，否则用人单位不得随意扣发员工工资。
- 劳动部《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第五十九条规定，虽然主要针对的是患病或非因工负伤的情况，但可类比于因不可抗力导致的缺勤，即员工不应因此被全额扣发工资。
二、实际情况分析
政府发布停工通知：
- 如果当地政府发布了停工通知，要求用人单位在台风期间停止工作，那么员工不上班是合法的，用人单位应当视为正常出勤，不得扣发工资。这是基于政府对公共安全的考虑，用人单位有义务遵守。
未发布停工通知但确实无法上班：
- 如果政府没有发布停工通知，但台风导致交通瘫痪、工作环境存在安全隐患等，使得员工客观上无法到岗工作，这种情况下员工应及时向单位说明情况并请假。用人单位应根据实际情况灵活处理，如允许员工远程办公、调休或事后补班等，而不应直接扣发工资。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中有明确约定在自然灾害等不可抗力情况下可以扣发工资，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能有权按照合同约定执行。但这种约定通常应合理且符合公平原则，且在实际操作中较为罕见。
三、法律建议与后果
员工建议：
- 在遇到台风等不可抗力因素时，员工应及时向单位说明情况并请假，保留好相关证据（如政府发布的停工通知、交通状况照片等），以备不时之需。
用人单位建议：
- 用人单位应建立健全的考勤制度和应急预案，以应对突发事件对员工出勤的影响。在处理因不可抗力导致的缺勤时，应遵循法律法规和规章制度，避免违法扣发工资。
法律后果：
- 如果用人单位违法扣发工资，员工有权向劳动保障行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付被扣发的工资及可能的赔偿金。根据《劳动保障监察条例》第二十六条，用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，由劳动保障行政部门责令限期支付；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。
综上所述，在台风导致无法上班的情况下，老板扣工资通常是不合法的。员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。