货物委托收货函盖合同章一般是有效的。以下从几个方面进行详细分析：

一、合同章的法律效力

合同章是公司专门用于签订合同的印章，它代表了公司的意志，具有法律效力。在授权委托的情境下，由于授权委托本身也属于合同性质的一种，因此使用合同章进行盖章并无不妥。法律并未明确规定必须使用公司公章而不能使用合同章来行使公司的权利，所以，从法律层面讲，货物委托收货函上加盖合同章是有效的。

二、实际案例与律师见解

在实际操作中，提货委托书（与货物委托收货函性质相似）加盖合同章的情况并不少见，且一般被认定为有效。律师也普遍认为，授权委托实际属于合同性质，盖合同章并无不妥，只要该委托行为是公司真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定。

三、注意事项

虽然货物委托收货函盖合同章一般是有效的，但为了确保其法律效力，还需注意以下几点：

1. 确保合同章的真实性：使用的合同章必须是公司正式备案的印章，避免使用伪造或变造的印章。
2. 明确委托内容：在货物委托收货函中，应明确委托的具体内容、范围、期限等，以避免产生歧义或纠纷。
3. 遵守法律法规：在委托过程中，应遵守相关法律法规的规定，不得进行违法或违规的操作。

四、可能的风险与应对

尽管加盖合同章的货物委托收货函一般有效，但仍存在一些潜在风险，如印章被盗用、委托内容不明确等。为了应对这些风险，建议：

1. 加强印章管理：公司应建立健全的印章管理制度，确保印章的安全使用。
2. 完善委托手续：在办理委托手续时，应尽可能完善相关文件，明确双方的权利和义务。
3. 及时处理纠纷：一旦发生纠纷，应及时采取措施进行处理，避免损失扩大。

总结来看，货物委托收货函盖合同章一般是有效的，但为了确保其法律效力并降低潜在风险，建议在使用合同章时遵循相关法律法规和公司内部规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。