再审程序撤销的是二审判决，若生效判决由一审法院作出且再审按一审程序审理的，则可能涉及对一审判决的实质性变更，但严格意义上再审直接撤销的是二审生效判决。以下是对此问题的详细分析：

一、再审程序的基本性质与目的

再审程序是针对已经发生法律效力的判决、裁定，因发现确有错误而进行的再次审理。其核心目的在于纠正原审判决中的错误，确保司法公正和当事人的合法权益。在再审过程中，法院会对原判决进行全面审查，包括事实认定、法律适用以及程序是否合法等方面。

二、再审判决与原判决的关系

1. 再审针对二审判决：

   • 在大多数情况下，再审程序是针对二审判决进行的。因为二审判决是终审判决，具有法律效力。如果当事人对二审判决不服，认为存在错误，可以向上一级法院申请再审。
   • 再审法院在审查过程中，如果发现二审判决在认定事实、适用法律等方面存在错误，会依法撤销或变更二审判决。

2. 一审判决的间接影响：

   • 虽然再审程序直接针对的是二审判决，但一审判决作为二审判决的基础，其内容也会在再审过程中受到审查。
   • 如果再审法院认为一审判决存在错误，且这种错误影响了二审判决的正确性，那么再审法院在撤销二审判决的同时，也会对一审判决的相关内容进行纠正。不过，这种纠正通常是通过撤销或变更二审判决来实现的，而不是直接撤销一审判决。
   • 特殊情形：若生效判决由一审法院作出，且再审按照第一审程序审理的，此时再审作出的判决、裁定，当事人可以上诉。若后续二审维持了再审一审的判决结果，则原一审判决实际上已被再审程序所覆盖并间接否定；若二审改判，则以二审改判结果为准。但严格从程序角度而言，再审直接撤销或变更的是“生效判决”（此时为原一审判决），不过这种情况属于再审按一审程序审理的特殊情形，并不改变“再审主要针对生效判决进行审查”这一本质。

三、再审判决的法律效力

• 再审判决一旦作出，即具有法律效力。如果再审判决撤销或变更了原判决（无论是二审还是特殊情形下的一审），那么原判决将不再具有法律效力。
• 当事人需按照再审判决来履行相关义务或享受相关权利。

四、实例说明

假设有一个案件，一审法院作出了判决，当事人不服提起上诉，二审法院维持了原判。后来，当事人发现二审判决存在错误，向上一级法院申请再审。再审法院经过审查，认为二审判决在认定事实或适用法律方面确实存在错误，于是依法撤销了二审判决，并作出了新的判决。在这个例子中，再审程序直接撤销的是二审判决，但由于二审判决是基于一审判决作出的，因此一审判决的相关内容也在再审过程中受到了间接审查和纠正。

总结：再审程序主要针对的是已经发生法律效力的二审判决进行审查。如果发现二审判决存在错误，再审法院会依法撤销或变更该判决。虽然一审判决作为二审判决的基础会受到间接审查，但再审程序并不直接撤销一审判决，而是通过撤销或变更二审判决来实现对一审判决相关内容的纠正（特殊情形下按一审程序再审的除外）。如有任何法律疑问，可直接向我咨询。