通常情况下，担保人在房屋登记上签字但担保合同上未签字，担保合同不生效。不过，也存在一些例外情况使得担保合同可能被认定有效。以下是对此问题的详细分析：
一、通常情况下担保合同不生效
合同成立要件：根据《民法典》的相关规定，合同自当事人均签名、盖章或者按指印时成立。担保合同作为合同的一种，需要担保人签字或盖章以表示其认可合同内容并愿意受合同约束。若担保人未在担保合同上签字，则意味着其未作出订立合同的意思表示，担保合同本应未成立、无效。
房屋登记签字与担保合同的关系：担保人在房屋登记上签字，可能仅表示其同意将房屋用于抵押，但并不等同于在担保合同上签字。房屋登记签字与担保合同签字是两个独立的法律行为，前者不能替代后者作为担保合同成立的依据。
二、例外情况下担保合同可能被认定有效
实际履行行为：若担保人虽未在担保合同上签字，但已经实际履行了担保义务，且债权人接受了该履行行为，那么根据《民法典》的相关规定，合同可能被认定成立并有效。例如，担保人代债务人偿还了部分债务，且债权人接受了该偿还行为。
主合同中的保证条款：如果主合同（如借款合同）中包含了保证条款，且担保人在主合同上以保证人的身份签字或盖章，那么即使担保人未在单独的担保合同上签字，也可能被视为保证合同成立。不过，这种情况并不适用于您所描述的情形，因为您提到的是担保人在房屋登记上签字，而非在主合同上签字。
三、法律建议
审查合同条款：对于涉及房产抵押担保的合同，应仔细审查合同条款，确保所有必要的手续都已完备，包括担保人的签字或盖章。
保留证据：若存在实际履行行为或其他可能证明担保合意的证据，应妥善保留，以备不时之需。
及时咨询：若对担保合同的效力存在疑问，或遇到相关法律纠纷，建议及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见和帮助。
举例说明：假设甲向乙借款，丙作为担保人。三方拟定了担保合同，但丙因故未在合同上签字。然而，在借款期间，丙代甲偿还了部分利息，且乙接受了该偿还行为。在此情况下，若乙能提供充分证据证明丙的实际履行行为，那么担保合同可能被认定有效。
总结来看，担保人在房屋登记上签字但担保合同上未签字，并不直接导致担保合同生效。不过，在存在实际履行行为等例外情况下，担保合同可能被认定有效。因此，在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并咨询专业律师以获取准确的法律意见。如果您有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。