针对您提出的“线路上私自变更设计怎么处罚”的问题，这通常涉及到未经批准擅自修改工程设计的情况，根据相关法律法规，特别是《公路建设监督管理办法》的相关规定，以下是对此类行为的处罚措施及流程的详细解答：
处罚依据
主要依据《公路建设监督管理办法》（交通部令2006年第6号）第三十九条，该条款明确规定了未经批准擅自修改工程设计的法律责任。
处罚措施
责令限期改正：一旦发现未经批准擅自修改工程设计的情况，相关部门会首先责令责任单位或个人在规定期限内进行改正，以恢复原设计或达到合规标准。
警告处罚：对于情节较轻的违规行为，相关部门可能会给予警告处罚，以警示责任单位或个人遵守规定。
暂停项目执行或暂缓资金拨付：对于情节严重的违规行为，特别是涉及全部或部分使用财政性资金的项目，相关部门有权暂停项目执行或暂缓资金拨付，直至问题得到妥善解决。
处罚流程
立案责任：相关部门在发现涉嫌未经批准擅自修改工程设计的违法行为后，会进行审查，并决定是否立案。
调查责任：立案后，相关部门会指定专人负责，及时组织调查取证。调查过程中，执法人员不得少于两人，且应出示执法证件，允许当事人辩解陈述，并保守有关秘密。
审查责任：审理案件调查报告时，相关部门会对案件违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行全面审查，并提出处理意见。
告知责任：在作出行政处罚决定前，相关部门会制作《行政处罚告知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。符合听证规定的，还会制作《行政处罚听证告知书》。
决定责任：相关部门会制作行政处罚决定书，载明行政处罚告知、当事人陈述申辩或者听证情况等内容。
送达责任：行政处罚决定书会按法律规定的方式送达当事人。
执行责任：最后，相关部门会执行生效的行政处罚决定。
总结与建议
未经批准擅自修改工程设计是严重的违规行为，不仅可能面临警告、罚款等处罚，还可能影响项目的正常执行和资金拨付。因此，建议相关单位和个人在工程设计过程中严格遵守规定，如有变更需求，应及时向相关部门申请并获得批准。
希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时联系相关部门或专业律师。