客户因某些原因扣供应商货款是否违法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
合同约定角度：
- 合法情况：如果货物买卖合同中明确约定了客户在特定情况下（如货物质量不符合约定、交货延迟等）有权扣减货款，且这些约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么客户扣减货款的行为是合法的。
- 违法情况：如果合同中没有相关约定，或者约定违反了法律、行政法规的强制性规定，客户擅自扣减货款就可能构成违约，需要承担相应的违约责任。
法律规定角度：
- 合法情况：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，如果供应商确实存在违约行为（如提供的货物质量不符合约定、未按照约定时间交货等），且这种违约行为给客户造成了损失，客户有权要求供应商承担违约责任，包括扣减相应的货款作为赔偿。但这种情况下，扣减货款的金额应当与供应商的违约行为造成的损失相当，不能随意扣减。
- 违法情况：如果客户没有合法依据（如合同约定或法律规定）而擅自扣减货款，就可能构成对供应商财产权的侵害，需要承担侵权责任。供应商有权要求客户返还被扣减的货款，并可能要求客户赔偿因此造成的损失。
实际操作角度：
- 建议做法：在实际操作中，为了避免纠纷和法律风险，客户和供应商应当在合同中明确约定货款支付的条件、方式和时间等事项，以及在何种情况下可以扣减货款。同时，双方应当保留好相关证据（如合同、交货单、质量检验报告等），以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
- 风险警示：如果客户擅自扣减货款且没有合法依据，供应商可能会通过法律途径维护自己的权益，包括提起诉讼或申请仲裁等。这将给客户带来不必要的法律风险和经济损失。
举例说明：假设一份货物买卖合同中约定，如果供应商提供的货物质量不符合约定标准，客户有权扣减货款总额的10%作为赔偿。后来，供应商提供的货物确实存在质量问题，客户按照合同约定扣减了货款总额的10%。这种情况下，客户的扣减行为是合法的。但如果合同中没有相关约定，或者客户扣减的货款金额超过了实际损失，那么客户的扣减行为就可能构成违法。
总结与建议：客户因某些原因扣供应商货款是否违法，取决于合同约定、法律规定以及实际操作情况。为了避免纠纷和法律风险，建议客户和供应商在合同中明确约定相关事项，并保留好相关证据。如果发生纠纷，建议双方通过协商、调解或法律途径解决。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。