核心结论：若分居三年后女方与他人怀孕，男方起诉你，需根据男方起诉的具体事由来应对，可能涉及离婚诉讼、重婚罪指控等不同情况。

具体分析：

1. 若男方起诉离婚并主张女方存在过错：

   • 法律背景：根据《民法典》相关规定，夫妻因感情不和分居满二年，经调解无效的，应当准予离婚。若男方以分居满三年且女方与他人怀孕为由，主张感情破裂要求离婚，法院一般会认定感情确已破裂，判决离婚。
   • 应对建议：此时，你应积极准备应诉，重点在于证明分居事实及感情破裂情况。若女方怀孕与他人无关（如人工授精等特殊情况），需提供相应证据。同时，可就财产分割、子女抚养等问题提出自己的主张。

2. 若男方指控你与女方构成重婚罪：

   • 法律背景：重婚罪是指有配偶而重婚，或者明知他人有配偶而与之结婚的行为。若你明知女方有配偶（即男方）仍与其以夫妻名义共同生活并导致怀孕，可能构成重婚罪。
   • 应对建议：首先，需明确你与女方是否以夫妻名义共同生活。若仅是普通同居关系，不构成重婚罪。若确实存在以夫妻名义共同生活的情况，建议尽快咨询律师，评估法律风险，并考虑是否通过和解、赔偿等方式减轻法律后果。

3. 若男方起诉要求赔偿精神损失：

   • 法律背景：在离婚诉讼中，若一方存在重大过错（如与他人通奸、同居等），导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。
   • 应对建议：若男方以此为由要求赔偿，你需评估自身行为是否构成重大过错。若不构成，可坚决否认并要求法院驳回对方诉求。若确实存在一定过错，可考虑通过协商方式解决，以减少法律纠纷和负面影响。

特别提醒：

• 在整个过程中，务必保持冷静，不要采取过激行为。
• 及时收集并保存相关证据，如分居协议、聊天记录、证人证言等，以备不时之需。
• 如有需要，可寻求专业律师的帮助，制定详细的应诉策略。

总结：面对男方的起诉，关键在于明确起诉的具体事由，并据此制定相应的应对策略。无论何种情况，都应积极应诉，维护自己的合法权益。如有进一步疑问或需要具体法律帮助，可直接向我咨询。