结论：招标单位被投标单位50%控股的情况下，一般不建议参与投标，且可能面临法律风险，具体需结合招标文件要求、控股关系性质及法律规定综合判断。以下是详细分析：

1. 法律对关联方投标的限制

根据《招标投标法实施条例》第三十四条，与招标人存在“利害关系可能影响招标公正性”的法人、其他组织或个人，不得参加投标。若投标单位控股招标单位50%，可能被认定为存在重大利害关系（如控制权影响招标决策），此时投标可能被认定为无效。

例外情形：若招标文件明确允许关联方投标，且能证明控股关系不影响招标公正性（如通过独立评标、第三方监督等），则可能被允许。但实践中此类例外极少，需严格审查招标文件条款。

2. 控股关系的具体影响

• 50%控股的特殊性：50%控股通常意味着共同控制或重大影响，但未达到绝对控股（如51%以上）。此时需进一步分析：
  • 若双方为母子公司关系（如投标单位是招标单位的母公司），则直接违反《招标投标法》中关于“不得与招标人存在控股关系”的隐性规定；
  • 若为兄弟公司（同一母公司控股两家单位），则需看招标文件是否禁止此类情形。
• 实质重于形式：即使法律未明确禁止50%控股，若实际存在控制或利益输送可能，仍可能被监管部门认定为违规。

3. 操作建议

1. 审查招标文件：重点查看“投标人资格条件”中是否明确排除关联方，或要求披露控股关系；
2. 主动披露与承诺：若决定投标，需在投标文件中如实披露控股关系，并承诺独立参与竞争，不利用控股地位影响招标；
3. 咨询监管部门：向招标人或当地招投标监管部门书面询问，获取书面确认是否允许参与；
4. 风险评估：若违规投标，可能面临中标无效、罚款、列入不良行为记录等后果，需权衡商业利益与法律风险。

4. 替代方案

若无法规避关联关系，可考虑：

• 由无关联的第三方参与投标；
• 调整股权结构（如降低控股比例至50%以下）；
• 等待招标人重新招标并修改资格条件。

提示：实践中，此类情形因易引发不公平竞争，监管态度通常严格。建议优先选择合规路径，避免后续纠纷。如有具体招标文件或股权结构细节，可进一步分析。