如果发现您的营业执照被他人非法使用，这是一个非常严重的问题，需要您立即采取行动来维护自己的合法权益。以下是我为您整理的详细处理步骤：
一、立即报警并报告工商部门
报警：在发现营业执照被盗用的第一时间，您应向当地公安机关报案。详细说明营业执照丢失和被盗用的情况，提供所有可能的线索，以便警方能够及时立案调查。
报告工商部门：同时，您需要向当地工商部门报告营业执照被盗用的情况。工商部门将根据您的报告，对您的营业执照进行挂失处理，并协助您重新办理新的营业执照。
二、收集并保存证据
在报警和报告工商部门的同时，您应尽可能收集能够证明营业执照被冒用的各种证据。这些证据可能包括现场照片、视频、交易记录、往来信件、通话录音等。这些证据将在后续的法律程序中发挥至关重要的作用，无论是民事诉讼还是刑事追诉。
三、声明作废并申请补领新执照
声明作废：您需要在国家企业信用信息公示系统上声明原营业执照作废。这一步骤是为了防止盗用者继续使用您的营业执照进行非法活动。
申请补领新执照：在声明作废后，您应向工商行政管理部门申请补领新的营业执照。申请时，您需要提供必要的证明材料，如报警记录、声明作废的公告等。
四、寻求法律救济
如果因营业执照被盗用而遭受了经济损失，您有权向人民法院提起诉讼，要求冒用者承担民事赔偿责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如果盗用行为构成犯罪，如诈骗罪或非法经营罪，您还有权要求追究冒用者的刑事责任。
五、加强内部管理并关注市场动态
加强内部管理：为了防止类似事件再次发生，您应加强公司内部管理，完善对营业执照等重要证件的保管制度。定期进行盘点和检查，确保证件的安全。
关注市场动态：密切关注市场动态，一旦发现有人冒用您的营业执照从事违法活动，应立即向相关部门举报并配合调查。
六、关注信用修复
营业执照被冒用可能会对企业的信用记录产生不良影响。因此，您应通过官方渠道查询企业的信用状况，并在必要时向相关信用管理部门提出信用修复申请。
综上所述，面对营业执照被盗用的情况，您需要迅速采取行动，包括报警、报告工商部门、收集证据、声明作废并申请补领新执照、寻求法律救济、加强内部管理和关注市场动态等。这些措施将有助于您保护公司权益，挽回损失，并防范类似事件的再次发生。