结论前置：关于工地工人失去保护自己后被惩罚六千元是否合法的问题，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
1. 惩罚的依据与合法性
- 若惩罚基于合法规章制度：
若工地有明确的规章制度，且该制度经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）、内容合法（不违反法律强制性规定）、已向劳动者公示，且工人确实存在违反该制度的行为（如未佩戴安全防护设备导致安全隐患），则工地依据制度对工人进行罚款可能合法。但罚款金额需合理，不得超过法定限额（如根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。若六千元罚款未超出合理范围且符合程序，则可能合法。
- 若惩罚无合法依据或程序违法：
若工地无合法规章制度，或制度未经过民主程序、未公示，或工人行为未违反制度，或罚款金额超出合理范围（如超过工人当月工资的20%），则工地罚款六千元可能违法。此时，工人有权拒绝缴纳罚款，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
2. 惩罚与工伤的关联性
- 若工人因未受保护而受伤：
若工人因工地未提供安全保护措施（如未配备安全帽、安全带等）而受伤，则工地可能构成违法。根据《工伤保险条例》，工人有权享受工伤保险待遇，且工地需承担相应赔偿责任。此时，工地对工人进行罚款可能被视为对工伤责任的逃避，不合法。
- 若工人未受伤但存在违规行为：
若工人未受伤，但存在违规行为（如未佩戴安全防护设备但未导致实际危害），则工地罚款的合法性需依据上述规章制度判断。若规章制度合法且工人行为违规，则罚款可能合法；否则，不合法。
3. 法律建议
- 工人角度：
若认为罚款不合法，可要求工地出示罚款依据（如规章制度、处罚决定书等），并核对其合法性。若工地无法提供合法依据或程序违法，可拒绝缴纳罚款，并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 工地角度：
工地应制定合法、合理的规章制度，并确保其经过民主程序、已公示。在处罚工人时，应确保程序合法、金额合理，并保留相关证据（如违规行为照片、证人证言等）。
4. 可能的法律后果
- 若罚款合法：
工人需缴纳罚款，但可要求工地提供合法依据。若工人认为罚款过高或不合理，可与工地协商或通过法律途径解决。
- 若罚款不合法：
工人有权拒绝缴纳罚款，并可要求工地返还已缴纳的罚款。同时，工地可能面临劳动监察部门的处罚（如罚款、责令改正等）。
总结：工地工人失去保护自己后被惩罚六千元是否合法，需结合具体情况判断。若惩罚基于合法规章制度且程序合法、金额合理，则可能合法；否则，不合法。工人有权要求工地出示合法依据，并可通过法律途径维护自身权益。如有具体疑问或需进一步帮助，可直接向我咨询。