工资支付责令整改的依据主要来源于《中华人民共和国劳动合同法》以及《劳动保障监察条例》等相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》

   • 该法第八十五条规定，用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
     • （一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
     • （二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
     • （三）安排加班不支付加班费的；
     • （四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
   • 此条款明确规定了劳动行政部门在用人单位未按时足额支付工资等情形下的责令整改及处罚权力。

2. 《劳动保障监察条例》

   • 该条例第二十六条规定，用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额或者解除劳动合同的经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50%以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金：
     • （一）克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的；
     • （二）支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的；
     • （三）解除劳动合同未依法给予劳动者经济补偿的。
   • 此条款进一步细化了劳动保障行政部门在用人单位工资支付违法行为上的责令整改及处罚措施。

二、责令整改的程序与后果

• 程序：当劳动行政部门或劳动保障行政部门发现用人单位存在未按时足额支付工资等违法行为时，会先进行调查核实，确认违法事实后，会向用人单位发出责令整改通知书，要求其在规定期限内支付拖欠的工资等。
• 后果：如果用人单位在规定期限内未进行整改或整改不到位，劳动行政部门或劳动保障行政部门有权进一步采取处罚措施，如加付赔偿金、行政处罚等，甚至可能将案件移送至司法机关处理。

三、实际案例与操作建议

• 实际案例：在实际操作中，劳动行政部门或劳动保障行政部门会定期对用人单位进行工资支付情况的检查，一旦发现违法行为，会立即启动责令整改程序。例如，某公司因经营困难拖欠员工工资数月，经劳动保障行政部门调查核实后，向该公司发出了责令整改通知书，要求其在15日内支付拖欠的工资。该公司最终在规定期限内支付了工资，避免了进一步的处罚。
• 操作建议：对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规，按时足额支付员工工资，避免违法行为的发生。一旦收到责令整改通知书，应立即采取措施进行整改，并在规定期限内完成整改任务，以避免进一步的法律后果。

如有任何关于工资支付或劳动纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。