甲方支付工资由乙方自行缴纳需满足甲方与乙方达成相关协议，并且该协议不违反法律法规的强制性规定。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 甲乙双方的协议

1. 协议内容：甲方与乙方需要就工资支付方式、金额、时间以及乙方自行缴纳税费等事项进行明确约定，并形成书面协议。这是确保双方权益的基础。
2. 协议合法性：该协议必须遵守国家法律法规，不得违反劳动法、税法等相关规定。例如，工资支付不得低于最低工资标准，税费缴纳需符合税法要求。

二. 乙方的责任与义务

1. 自行缴纳税费：根据协议，乙方需承担自行缴纳个人所得税等税费的责任。乙方应了解相关税法规定，确保按时足额缴纳。
2. 合规使用工资：乙方在收到甲方支付的工资后，应合规使用，不得用于非法活动。

三. 甲方的监督与协助

1. 监督义务：虽然工资由乙方自行缴纳，但甲方仍有一定的监督义务，确保乙方按时缴纳税费，避免产生法律纠纷。
2. 提供必要协助：如乙方在税费缴纳过程中遇到问题，甲方应提供必要的协助，如提供相关信息、解答疑问等。

四. 法律法规的遵循

1. 遵守劳动法：甲乙双方应严格遵守《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，确保工资支付和税费缴纳的合法性。
2. 遵守税法：乙方在自行缴纳税费时，应遵守《中华人民共和国个人所得税法》等税法规定，确保税费缴纳的准确性和及时性。

综上所述，甲方支付工资由乙方自行缴纳需满足甲乙双方达成相关协议，并且该协议不违反法律法规的强制性规定。同时，乙方需承担自行缴纳税费的责任，甲方则负有监督义务和提供必要协助的义务。我建议在实际操作中，甲乙双方应充分沟通并明确协议内容，确保双方权益得到保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。