关于补贴发放后不符合要求追回款项是否违法的问题，需分情况讨论，总体而言，若追回行为合法合规，则不构成违法；反之，则可能涉及违法。以下从不同角度为您详细分析：

1. 补贴发放的合法性与合规性

• 合法发放：若补贴的发放原本就符合相关法律法规、政策规定及合同约定，但后续因发现不符合特定条件（如资格审核错误、信息不实等）而追回，这种追回行为通常是合法的。因为补贴的发放并非无条件，一旦发现不符合条件，发放方有权要求返还。
• 非法发放：若补贴的发放本身就存在违法违规行为，如未经批准擅自发放、发放对象错误等，那么追回行为虽然可能纠正了错误，但发放和追回的全过程都可能涉及违法。不过，就追回行为本身而言，若是为了纠正之前的违法发放，且追回方式合法，则追回行为本身不构成新的违法。

2. 追回行为的合法性与程序

• 合法追回：追回补贴应当遵循法定程序，如通过书面通知、协商、法律诉讼等方式进行。若追回行为遵循了这些程序，且没有侵犯被追回方的合法权益，那么追回行为是合法的。
• 非法追回：若追回行为采取了非法手段，如威胁、恐吓、私自扣款等，那么这种追回行为就是违法的。即使补贴原本就不应发放，也不能通过非法手段来追回。

3. 涉及金额与法律后果

• 金额大小：虽然您提到的金额超过40万，但金额的大小本身并不直接决定追回行为的合法性。关键在于追回行为是否合法合规。不过，金额较大时，追回行为可能更加谨慎，以避免引发更大的法律纠纷。
• 法律后果：若追回行为合法，则被追回方应当返还补贴，并可能承担因自身不符合条件而产生的其他责任。若追回行为违法，则追回方可能面临法律制裁，如赔偿损失、承担行政责任等。

4. 具体建议

• 核查发放与追回的合法性：首先，需要核查补贴的发放和追回是否都符合相关法律法规、政策规定及合同约定。
• 遵循法定程序：若决定追回补贴，应当遵循法定程序，确保追回行为的合法性。
• 协商与法律途径：在追回过程中，建议优先通过协商方式解决。若协商无果，再考虑通过法律诉讼等途径解决。
• 咨询专业律师：由于劳动工伤和合同纠纷领域的法律问题较为复杂，建议在处理此类问题时咨询专业律师，以确保自身权益得到保障。

总结来说，补贴发放后不符合要求追回款项是否违法，取决于追回行为的合法性和合规性。若追回行为合法合规，则不构成违法；反之，则可能涉及违法。在处理此类问题时，建议遵循法定程序，并咨询专业律师以确保自身权益。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。