供应商不足三家时，响应文件一般应当退回，但在特定情形下可以继续磋商。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：供应商不足三家，响应文件应退回
在政府采购或货物买卖合同纠纷中，若采用竞争性磋商等采购方式，通常要求实际参加采购的供应商不少于三家。这是为了确保采购活动的竞争性和公平性。如果供应商不足三家，即实际参加磋商采购（提交响应文件）的供应商数量不满足要求，那么根据相关规定，采购人邀请供应商不成功，不符合采购活动的要求，因此响应文件一般应当退回，不能继续开展磋商。
二、特定情形：供应商不足三家，但可以继续磋商
尽管一般原则要求供应商不少于三家，但在特定情形下，即使实质性响应的供应商只有两家，也可以继续开展磋商。这些特定情形主要包括：
市场竞争不充分的科研项目：对于这类项目，由于市场供给情况不理想，满足采购需求的供应商数量可能不足。在邀请供应商时，如果采用公告方式且磋商过程实质性响应仅有两家，或者采用随机抽取、推荐方式邀请且事先了解符合资格条件的供应商数量不多（如仅有三家或四家），可以判定市场竞争不充分，此时可以继续开展磋商。
需要扶持的科技成果转化项目：这类项目通常具有特殊性，可能需要政府或相关机构的扶持。在供应商不足三家的情况下，为了推动科技成果的转化和应用，可以继续开展磋商。
政府购买服务项目（含政府和社会资本合作项目）：根据《财政部关于政府采购竞争性磋商采购方式管理暂行办法有关问题的补充通知》的规定，在采购过程中符合要求的政府购买服务供应商（社会资本）只有两家的，竞争性磋商采购活动可以继续进行。但需要注意的是，这里的“符合要求”指的是符合磋商文件要求，即实质性响应磋商文件需求。
三、法律建议与风险提示
严格遵守采购程序：采购人应严格按照相关法律法规和采购文件的要求进行操作，确保采购活动的合法性和合规性。在供应商不足三家的情况下，除非符合特定情形，否则应退回响应文件并重新组织采购活动。
科学编制采购文件：采购人应仔细检查采购文件是否有特殊资格要求或异常特殊要求，防止因设置不当而限制供应商参与采购活动。同时，应确保采购文件的公平性和公正性，维护政府采购竞争秩序。
及时采取补救措施：如果采购活动因供应商不足三家而无法继续进行，采购人应及时采取补救措施，如重新组织采购活动、变更采购方式等。在变更采购方式时，应提前办理审批手续并确保变更后的采购方式符合法律法规的要求。
注意法律风险：在采购活动中，采购人应始终坚持以法律为教训，严格依法经营。任何试图通过“灵活”措施逃避法律责任的行为都可能带来法律风险，并可能对采购活动的公平性和公正性造成影响。
如果您在货物买卖合同纠纷或政府采购活动中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。