结论前置：
- 私下签订的合同无法直接赋予非营业执照上登记的股东以合法股东身份。股东身份需通过公司章程、股东名册及工商登记等法定程序确认。
- 私下合同可约定股权代持、股权转让或利润分配等权益，但需注意法律风险及合规性。
详细分析：
一、股东身份的法定确认
根据《公司法》及相关规定，股东身份的确立需通过以下法定程序：
- 公司章程：公司章程是公司设立的基本文件，其中应明确记载股东的姓名或名称、出资方式、出资额及股权比例等信息。
- 股东名册：公司应置备股东名册，记载股东的姓名或名称、住所、出资额及出资证明书编号等事项。股东名册是确认股东资格的重要依据。
- 工商登记：公司应将股东信息向工商行政管理部门登记，未经登记或变更登记的，不得对抗第三人。工商登记具有公示公信力，是确认股东身份的最终环节。
因此，若某人未在营业执照上登记为股东，且未通过公司章程、股东名册及工商登记等法定程序确认其股东身份，则其无法成为公司的合法股东。
二、私下合同的法律效果
尽管私下签订的合同无法直接赋予非营业执照上登记的股东以合法股东身份，但双方仍可通过合同约定相关权益，如：
- 股权代持协议：实际出资人与名义股东可签订股权代持协议，约定由名义股东代为持有股权，实际出资人享有投资收益等权益。但需注意，股权代持协议仅在双方之间有效，不得对抗善意第三人。
- 股权转让协议：若双方约定在未来某一时间点或满足一定条件时，由营业执照上的股东将其股权转让给非登记股东，则可签订股权转让协议。但股权转让需遵循公司章程及《公司法》的相关规定，如需其他股东过半数同意、优先购买权行使等。
- 利润分配协议：双方可约定非登记股东按一定比例享有公司利润分配权。但需注意，该协议不得违反公司章程及《公司法》中关于利润分配的规定。
然而，私下签订的合同存在以下法律风险：
- 合同效力风险：若合同内容违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗，则合同可能被认定为无效。
- 对抗第三人风险：私下合同仅在双方之间有效，无法对抗善意第三人。如名义股东擅自处分股权，实际出资人可能面临权益受损的风险。
- 税务风险：私下合同可能涉及偷逃税款等违法行为，一旦被发现，将面临税务处罚及法律责任。
三、法律建议
- 完善法定程序：若非登记股东希望成为公司合法股东，应通过公司章程修改、股东名册变更及工商登记等法定程序确认其股东身份。
- 谨慎签订私下合同：在签订私下合同时，应确保合同内容合法合规，并明确双方的权利义务及违约责任。同时，可考虑将合同内容向公司及其他股东披露，以降低法律风险。
- 寻求专业法律帮助：在涉及股权纠纷等复杂法律问题时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到合法保护。
如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。