挂靠行为因违反法律法规的强制性规定而被认定为不合法后，确实无法再通过挂靠协议来规范双方行为，但可以考虑其他合法的合作协议形式。以下是从不同角度对这一问题的分析：
一、挂靠协议的不合法性
挂靠行为通常指的是没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义承揽工程，这种行为违反了《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规的强制性规定，因此挂靠协议自始无效。这意味着，双方无法通过挂靠协议来合法地规范彼此的行为和权利义务。
二、其他合法的合作协议形式
尽管挂靠协议不合法，但双方仍可以通过其他合法的合作协议形式来达成合作。这些协议应当遵循相关法律法规的规定，确保合作行为的合法性和有效性。以下是一些可能的合作协议形式：
联营合作协议：
- 双方可以签订联营合作协议，共同出资、共同经营、共担风险、共享收益。这种协议形式下，双方作为平等的合作伙伴，共同参与项目的实施和管理。
- 联营合作协议应当明确双方的权利义务、出资比例、利润分配方式、风险承担机制等关键条款，以确保合作的顺利进行。
分包合作协议：
- 如果一方具有特定的资质或能力，而另一方需要这些资质或能力来完成项目，双方可以签订分包合作协议。
- 在分包合作协议中，具有资质的一方作为总承包方，将部分工程或任务分包给另一方完成。分包方应当按照总承包方的要求完成工作，并接受总承包方的监督和管理。
- 分包合作协议应当明确分包范围、质量标准、工期要求、价款支付方式等关键条款，以确保分包工作的顺利进行。
委托代理协议：
- 如果一方需要另一方代表其进行某些活动或处理某些事务，双方可以签订委托代理协议。
- 在委托代理协议中，委托方授权代理方以委托方的名义进行活动或处理事务，代理方应当在委托方的授权范围内行事，并接受委托方的监督。
- 委托代理协议应当明确代理事项、代理权限、代理期限、代理费用等关键条款，以确保代理行为的合法性和有效性。
三、法律建议
审慎选择合作形式：
- 在选择合作形式时，双方应当审慎考虑各自的资质、能力、风险承受能力等因素，选择最适合双方的合作形式。
- 避免再次选择挂靠等不合法的合作形式，以免面临法律风险和损失。
明确协议条款：
- 无论选择哪种合作形式，双方都应当明确协议条款，确保协议内容合法、有效、明确。
- 协议条款应当包括双方的权利义务、合作方式、利润分配、风险承担、违约责任等关键内容。
遵守法律法规：
- 在合作过程中，双方应当遵守相关法律法规的规定，确保合作行为的合法性和有效性。
- 如果遇到法律问题或纠纷，应当及时咨询专业律师，寻求法律帮助和解决方案。
如有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。