项目员工挪用公款不能仅做内部处理。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律定性角度

挪用公款行为，无论涉及的是国家工作人员还是公司员工，均可能构成犯罪。

• 国家工作人员：若其利用职务之便，挪用公款用于非法活动、营利活动，或者数额较大且超过三个月未还，将构成挪用公款罪。
• 公司员工：若其利用职务之便，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，将构成挪用资金罪。

这两种行为均触犯了刑律，必须由司法机关依法追究刑事责任，单位不能自行内部消化。

二、单位处理权限与限制角度

• 内部处理权限：对于员工的一般违规行为，单位有权根据内部规章制度进行警告、记过、解除劳动合同等处理。然而，当员工的行为涉嫌犯罪时，单位的内部处理权限便受到限制。
• 内部处理限制：单位发现员工挪用公款线索后，应立即向监察机关、公安机关等报案，并配合司法机关调查处理。若单位选择内部处理而不报案，可能构成包庇犯罪，相关责任人也将承担法律责任。

三、实际案例与后果角度

• 实际案例：以某国家单位工作人员小许为例，他利用职务便利挪用公款用于个人营利活动。单位发现后，部分领导考虑内部影响打算内部处理，但也有领导认为应向司法机关报案。最终，若单位选择内部处理而不报案，将面临法律风险。
• 法律后果：若单位包庇挪用公款的员工，不仅可能使违法犯罪行为得不到应有的惩处，还会破坏法律的严肃性。同时，相关责任人可能因包庇犯罪而承担刑事责任。

四、建议与措施角度

• 及时报案：单位发现员工挪用公款线索后，应迅速向司法机关报案，并提供准确信息，全力协助调查。
• 固定证据：在报案前，单位应做好内部调查工作，固定相关证据，如账目、资金流向等，以便司法机关进行侦查。
• 完善制度：单位应完善内部财务管理制度，加强对员工的教育和管理，防止类似事件再次发生。

总结来看，项目员工挪用公款不能仅做内部处理。单位应依法向司法机关报案，并配合调查处理。若您在处理此类事件时遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。