合作方余款退还，一般不算职务侵占，但需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、职务侵占的定义与构成要件
根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。构成职务侵占罪，需要满足以下几个要件：
- 主体要件：行为人必须是公司、企业或者其他单位的人员。
- 主观要件：行为人必须具有非法占有的故意。
- 客观要件：行为人必须利用职务上的便利，实施了将本单位财物非法占为己有的行为。
- 数额要件：非法占有的财物数额必须达到较大标准。
二、合作方余款退还的情况分析
有正当职务依据且及时退还：
- 如果行为人收取合作方余款有正当的职务依据，比如是按照合同约定或公司规定代收款项，并且在之后及时退还了款项，那么说明行为人没有将财物非法占为己有的故意和行为。
- 这种情况下，一般不构成职务侵占。因为行为人没有利用职务便利将本单位财物非法占为己有，也没有造成单位财产权益的侵害。
利用职务便利且有侵占故意：
- 如果行为人收取合作方余款时利用了职务便利，比如是公司的财务人员或管理人员，利用管理、经手款项的便利条件收取款项，并且有将款项非法占为己有的故意，即使之后退还了款项，也可能涉嫌职务侵占。
- 这种情况下，可能构成职务侵占。因为行为人具有非法占有的故意，并且利用了职务便利实施了侵占行为，只是后来因为害怕被发现或其他原因才退还了款项。
三、实际案例与法律建议
- 实际案例：假设某公司员工小李，作为项目负责人，收取了合作方支付的一笔余款。小李称其收钱有正当职务依据，且之后已将款项退还公司。但如果小李在收取款项时，就有将款项用于个人消费或投资的打算，只是后来因为公司查账或合作方催要才退还，那么小李就可能涉嫌职务侵占。
- 法律建议：
- 如果您是行为人，且收取合作方余款有正当职务依据并及时退还，建议保留好相关证据，如收款凭证、退还记录等，以证明自己的清白。
- 如果您是单位或合作方，怀疑行为人涉嫌职务侵占，建议及时收集相关证据，如转账记录、聊天记录、证人证言等，并向公安机关报案。
四、可能的法律后果
- 如果构成职务侵占罪，根据《中华人民共和国刑法》的规定，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役；数额巨大的，处五年以上有期徒刑，可以并处没收财产。
- 如果不构成职务侵占罪，但行为人存在其他违法行为，如挪用资金、诈骗等，也可能面临相应的法律责任。
总结来看，合作方余款退还是否构成职务侵占，关键在于行为人是否有利用职务便利非法占有单位财物的主观故意和客观行为。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。