在合同履行过程中，如果发现所签订的合同实际上是挂靠合同，这确实是一个需要谨慎处理的问题。挂靠合同往往涉及法律上的复杂性和潜在风险，因此，以下是一些建议的处理步骤，希望能为您提供清晰、详细且有深度的指导。

一、确认挂靠合同的事实

首先，您需要仔细审查合同内容，确认是否存在挂靠的实质。挂靠合同通常表现为一方（挂靠方）以另一方（被挂靠方）的名义进行经营活动，而实际经营者和风险承担者往往是挂靠方。如果合同中存在这样的安排，且未经合法授权或违反相关法律法规，那么该合同很可能就是挂靠合同。

二、评估法律风险和后果

在确认挂靠合同后，您需要评估由此可能带来的法律风险和后果。挂靠合同可能涉及违法经营、税务问题、合同无效、赔偿责任等多方面的法律风险。因此，您需要咨询专业的法律人士，对合同进行全面的法律风险评估。

三、与对方协商解决

如果可能的话，您应该首先尝试与对方进行协商，寻求和平解决纠纷的方式。在协商过程中，您可以提出对合同进行修改或补充，以消除挂靠的实质，或者协商解除合同并妥善处理后续事宜。如果双方能够达成一致，那么可以签订调解协议，明确各自的权利和义务。

四、申请仲裁或提起诉讼

如果协商不成，您需要根据合同中的仲裁条款或双方约定的争议解决方式，向约定的仲裁机构申请仲裁，或者向有管辖权的法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明挂靠合同的存在以及由此带来的损失或损害。仲裁机构或法院将根据相关法律法规和合同条款，对纠纷进行审理并作出裁决。

五、遵守法律程序和裁决结果

无论采取哪种解决方式，您都需要严格遵守法律程序和裁决结果。如果仲裁机构或法院作出了有利于您的裁决，您需要确保对方按照裁决结果履行义务。如果对方不履行裁决，您可以依法申请强制执行。

六、加强后续合同管理和风险防范

最后，为了避免类似问题的再次发生，您需要加强后续的合同管理和风险防范。在签订合同前，您应该对对方的资质、信誉和经营能力进行充分的调查和了解。同时，在合同中明确双方的权利和义务，以及争议解决的方式和程序。此外，您还可以考虑购买相关的保险或担保，以降低合同履行过程中的风险。

总之，处理挂靠合同纠纷需要谨慎、专业和全面的考虑。希望以上建议能够对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或困难，建议及时咨询专业的法律人士。