核心结论：出纳渎职违规转账100万，可能涉及刑事责任、民事赔偿责任及单位内部管理责任，需根据具体情节从法律追责、内部追偿、制度完善三方面处理。以下分情况说明：

1. 刑事责任追责

若出纳通过伪造凭证、私刻公章、冒用领导签字等手段违规转账，可能涉嫌职务侵占罪或挪用资金罪：

• 职务侵占罪（《刑法》第271条）：若出纳利用职务便利，将单位资金非法占为己有，数额较大（100万属“数额巨大”），可处3年以上10年以下有期徒刑，并处罚金。
• 挪用资金罪（《刑法》第272条）：若出纳将资金挪作个人使用，未归还或用于非法活动，数额较大（100万属“数额较大”），可处3年以上7年以下有期徒刑。 处理建议：单位应立即向公安机关报案，由经侦部门立案侦查，固定转账凭证、银行流水、审批记录等证据，追究出纳刑事责任。

2. 民事赔偿责任

无论是否构成犯罪，出纳均需对单位承担民事赔偿责任：

• 法律依据：《民法典》第1165条（过错责任）、第1191条（用人单位责任）。单位可要求出纳返还全部违规转账金额，并赔偿因资金占用导致的利息损失、交易机会损失等间接损失。
• 追偿程序：单位可通过内部追偿流程（如扣发工资、奖金）或直接向法院提起民事诉讼，要求出纳赔偿损失。若出纳无力偿还，可申请强制执行其财产。

3. 单位内部管理责任

单位需自查是否存在管理漏洞，避免被认定为“共同过失”：

• 财务制度漏洞：如未严格执行“双人复核”“印章分离”“大额转账审批”等制度，单位可能因管理失职被监管部门处罚（如银保监会、财政局）。
• 追责建议：
  • 对直接责任人（如财务主管、审批领导）进行内部处分（降职、扣薪）；
  • 完善财务审批流程，明确各级审批权限；
  • 定期开展财务合规培训，强化员工法律意识。

4. 特殊情形处理

• 若出纳系被诈骗或胁迫转账：需立即报警，同时向银行申请冻结账户、追回资金。若能证明出纳无主观过错，可减轻或免除其责任，但单位仍需承担管理责任。
• 若资金已无法追回：单位可向保险公司投保“员工忠诚保险”或“资金安全险”，通过保险理赔弥补部分损失。

行动建议：单位应第一时间固定证据（如转账记录、审批文件、出纳陈述），同步启动刑事报案、民事追偿、内部整改程序，避免损失扩大。如有具体情节需进一步分析，可直接向我咨询。