建设工程合同无效时，一般不可以主张合同违约金，但可以按照其他法律关于合同无效和解除后的处理原则行使损害赔偿请求权。以下是对此问题的详细分析：
一、合同无效与违约金的关系
合同无效的法律后果：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的或者被撤销的民事法律行为自始没有法律约束力。这意味着，一旦合同被认定为无效，它自始至终都不具有法律效力，因此合同中的违约金条款也自然无效。
违约金的有效性基础：
- 违约金的有效性是建立在合同有效的基础上的。如果合同无效，那么违约金条款也就失去了其存在的法律基础，因此不能主张违约金。
二、合同无效后的处理原则
损害赔偿请求权：
- 虽然合同无效后不能主张违约金，但根据《中华人民共和国民法典》关于合同无效和解除后的处理原则，当事人可以行使损害赔偿请求权。这意味着，如果因合同无效导致了一方或双方的损失，受损方有权要求造成损失的一方进行赔偿。
工程价款的支付：
- 对于建设工程施工合同无效的情况，如果建设工程经竣工验收合格，承包人仍然可以请求发包人支付价款。这是基于合同无效不影响解决争议条款的效力，以及保障承包人合法权益的考虑。
修复费用的承担：
- 如果建设工程经验收不合格，但能够修复的，发包人应当支付价款，但修复费用由承包人承担。这是为了促使承包人积极修复工程，确保工程质量。
三、实践判例中的处理方式
- 在实践判例中，建设工程合同确认无效的，由于当事人无约定违约金条款，因此不再适用违约金。但法院会根据具体情况，按照其他法律关于合同无效和解除后的处理原则，判决当事人承担相应的损害赔偿责任。
四、建议与注意事项
签订合同时的注意事项：
- 在签订建设工程施工合同时，双方应确保合同内容合法、有效，并明确约定违约责任和损害赔偿方式。这有助于在合同履行过程中减少纠纷，保障双方的合法权益。
合同无效后的应对措施：
- 如果合同被认定为无效，双方应积极协商解决纠纷，按照法律规定和合同约定承担相应的责任。如果协商不成，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
寻求专业法律帮助：
- 在处理建设工程合同纠纷时，建议当事人寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助当事人维护自己的合法权益。
如有任何关于建设工程合同纠纷的法律问题，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。