设施农用地违法是否需要拆除，需根据具体情况判断，并非一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、必须拆除的情况
侵占基本农田：
- 根据《土地管理法》，永久基本农田经依法划定后，任何单位和个人不得擅自占用或者改变其用途。若设施农用地违法侵占了基本农田，用于建设非农业经营的设施（如大棚房内建设餐饮、住宿等经营性场所），则必须坚决拆除，恢复耕种条件。
位于禁止建设区域：
- 若设施农用地位于生态保护红线区、饮用水水源保护区、自然保护区核心区/缓冲区等禁止建设区域，且建设的设施与保护目标相冲突（如养殖场、工厂等），则必须依法拆除或搬迁，以恢复生态。
未经合法审批的“新增”违法建设：
- 若设施农用地未经合法审批，擅自将农用地转为建设用地进行建设，或未取得乡村建设规划许可证、未按许可证内容建设，则属于严重的土地违法行为。相关建筑物可能面临拆除，土地也需复垦。
二、可不拆除的特殊情况
符合规划且可补办手续：
- 若设施农用地虽初始缺乏必要手续，但符合土地利用总体规划和乡村规划等要求，且当事人能够按照规定补办相关审批手续，则该设施在补办手续后可保留，无需拆除。
拆除影响公共利益：
- 当拆除违法建设的设施农用地可能对公共安全、公共交通、公共设施等造成重大损害时，为保护公共利益，可能不会立即拆除该设施。而是会采取其他整改措施，如限期整改、罚款等，以确保在不影响公共利益的前提下解决违法问题。
历史遗留问题且有合理原因：
- 对于一些形成时间较长、属于特定历史时期产物的违法设施农用地，若建设时具有一定的合理原因（如当时政策允许、缺乏明确规划等），且不严重影响当前规划，可能会根据当地政策进行合理处置，而非一味拆除。例如，通过罚款、补办手续等方式进行整改。
三、法律建议与总结
- 了解并遵守相关法律法规：在建设设施农用地前，务必了解并遵守《土地管理法》、《城乡规划法》等相关法律法规，确保建设的合法性和合规性。
- 积极配合调查和处理：若设施农用地已被认定为违法，应积极配合相关部门的调查和处理工作，根据实际情况选择最合适的解决方案（如补办手续、限期整改、拆除等）。
- 寻求专业法律帮助：在处理设施农用地违法问题时，若遇到复杂情况或不确定如何处理，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
总之，设施农用地违法是否需要拆除，需根据具体情况判断。在处理此类问题时，应综合考虑法律法规、规划要求、公共利益以及历史因素等多方面因素，以做出最合理的决策。如果您在设施农用地方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。