结论：从现有公开信息来看，贾鲁河复航工程建设用地预审意见的批复程序符合法定要求，暂未发现违法情形。

一、结合新闻背景分析批复程序合法性

根据新闻背景，贾鲁河复航工程用地预审意见已于2025年9月9日获自然资源部批复（自然资办函〔2025〕2085号）。批复前，贾鲁河建设公司已按程序完成现场踏勘、用地预审评审会等环节，并于9月1日将材料报送自然资源部。这一流程符合《建设项目用地预审管理办法》中关于“逐级上报、限时办结”的要求，且自然资源部作为国务院授权的用地预审主管部门，其批复行为具有法定效力。

二、批复程序合法性分析维度

1. 主体资格合法

根据《土地管理法》第四十五条，建设用地预审需由自然资源主管部门（原国土资源部）负责。本案中，自然资源部作为国家级主管部门，直接批复省级重点项目用地预审，符合“分级审批”原则。此外，批复文件明确标注文号（自然资办函〔2025〕2085号），形式要件完备。

2. 程序要件合法

（1）前置程序履行：贾鲁河建设公司已按《建设项目用地预审管理办法》第七条，完成现场踏勘、用地预审评审会等前置程序，并提交省级自然资源部门初审意见。
（2）报批时效合规：材料于9月1日报部，9月9日获批，未超过《办法》规定的“20个工作日”审查期限。
（3）批复内容明确：批复文件明确同意用地预审，并要求项目单位在后续阶段落实节约集约用地、补偿安置等要求，符合《办法》第十一条关于“预审意见应包含用地规模、供地政策等内容”的规定。

3. 实体要件合法

（1）规划符合性：项目选址已纳入《河南省国土空间总体规划（2021-2035年）》重点建设项目清单，不涉及永久基本农田和生态保护红线，符合《土地管理法》第十九条关于“建设项目需符合国土空间规划”的要求。
（2）用地规模合理：批复未提及超规模用地问题，结合同类项目（如京杭运河淮安四线船闸工程）的用地标准，可推断本项目用地规模符合控制指标。
（3）补偿安置保障：批复要求“及时足额支付补偿费用，落实被征地农民社会保障措施”，符合《土地管理法》第四十八条关于“征收土地应给予公平、合理补偿”的规定。

三、潜在风险点提示

尽管当前程序合法，但需关注以下后续环节：

1. 正式用地审批：用地预审意见有效期为三年，项目单位需在有效期内取得立项批复，并依法办理农用地转用和土地征收手续（《土地管理法》第四十四条）。
   
2. 生态管控合规：项目涉及生态空间管控区，需确保后续施工符合《大运河江苏段核心监控区国土空间管控暂行办法》等区域性法规（虽本案为河南项目，但同类工程生态管控要求可参考）。
   
3. 公众参与程序：若项目涉及集体土地征收，需按《土地管理法》第四十七条履行听证、公告等程序，避免因程序瑕疵引发争议。

四、延伸建议

1. 对项目单位的建议：
   
   • 尽快完成立项批复、参建单位招标等开工前置条件，避免预审意见过期；
     
   • 在施工阶段严格落实节约集约用地要求，优化设计方案，减少土地占用。
     
2. 对公众的启示：
   
   • 土地预审仅是项目合法性的初步审查，公众可关注后续用地审批、环境影响评价等公开信息，行使监督权；
     
   • 若发现项目存在未批先建、违规补偿等情形，可向自然资源部门举报或通过行政复议、诉讼途径维权。

总结：贾鲁河复航工程用地预审批复程序目前合法，但项目单位需在后续阶段持续合规推进，公众亦可依法参与监督。如有具体环节疑问，可进一步提供细节以便深入分析。