针对您提出的问题，即“老人将股份给了其中一个儿子但户口不在本村过不了户，老人百年后这个协议还有效吗”，我们可以从法律的角度进行详细分析。
首先，我们需要明确的是，股份的转让或赠与协议，其法律效力并不直接受户口所在地的影响。户口问题主要关联到的是某些特定权益（如土地权益、集体福利等）的享受，而股份作为财产性权益，其转让或赠与通常遵循的是《中华人民共和国民法典》中关于合同和财产权的规定。
接下来，我们分析协议的有效性。一个协议要具有法律效力，通常需要满足以下几个条件：
双方意思表示真实：即老人和接受股份的儿子在签订协议时，都是出于自愿，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。
协议内容合法：协议的内容不能违反法律、行政法规的强制性规定，也不能违背公序良俗。
协议形式符合要求：虽然股份转让协议不一定需要特定的形式（如书面或口头），但为了证明协议的存在和内容，书面形式通常更为稳妥。
具备相应的民事行为能力：签订协议的双方都需要具备相应的民事行为能力，即能够理解和判断自己的行为后果。
在您描述的情况中，如果老人和儿子之间的股份赠与协议满足了上述条件，那么该协议在法律上是有效的。即使户口不在本村，导致无法立即办理过户手续，这并不影响协议本身的法律效力。
关于老人百年后协议的效力：
如果老人在生前已经与儿子签订了有效的股份赠与协议，并且该协议没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有被撤销或认定为无效，那么在老人去世后，该协议仍然具有法律效力。
儿子可以根据该协议要求其他继承人或相关方履行过户义务（如果过户条件随后满足，如户口问题得到解决）。
如果因为户口问题导致过户一直无法进行，儿子可以通过法律途径主张自己的权益，比如要求确认股份归属或要求相关方协助办理过户手续。
建议：
为了确保协议的效力，建议老人和儿子在签订协议时，尽量采用书面形式，并明确双方的权利和义务。
如果可能的话，可以咨询专业的法律人士，对协议进行审查和修改，以确保其合法性和有效性。
在老人去世后，如果遇到过户问题或其他纠纷，儿子应及时寻求法律帮助，维护自己的合法权益。
综上所述，老人将股份赠与其中一个儿子的协议，在满足一定条件下是具有法律效力的，并且这种效力并不因老人去世或户口问题而消失。