若法院调解书中约定的利息高于法律规定的上限，当事人可以在法定期限内申请再审。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的调解书，如果提出证据证明调解违反自愿原则或者调解协议的内容违反法律的，可以申请再审。经人民法院审查属实的，应当再审。这意味着，如果调解书中的利息约定超出了法律规定的上限，即违反了法律，当事人有权申请再审。
二、申请再审的条件与程序
条件：
- 当事人需提供充分证据证明调解书中的利息约定超出了法律规定的上限。
- 申请再审需在法定期限内提出，通常为调解书生效后的一定时间内（具体期限依据相关法律规定）。
程序：
- 当事人应向作出调解书的法院或其上级法院提交再审申请书及相关证据材料。
- 法院将对再审申请进行审查，如果认为符合再审条件，将裁定再审。
- 再审过程中，法院将重新审查调解书的内容，包括利息约定是否合法。
三、超出法律规定的利息部分的处理
未履行情况：
- 如果调解书尚未履行，当事人可以在执行程序中向执行法院提出执行异议，指出利息约定违法，请求法院审查并调整执行金额。
已履行情况：
- 如果调解书已经履行完毕，当事人可以收集证明利息约定违法及违反自愿原则等证据，通过再审程序申请纠正。经法院审查属实的，将依法对调解书内容进行调整，以确保利息符合法律规定。
四、实际建议
- 收集证据：在申请再审前，当事人应充分收集证据，包括借款合同、调解书、支付利息凭证等，以证明利息约定超出法律规定上限的事实。
- 咨询专业律师：虽然我作为张敬辉律师已经给出了专业分析，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，建议当事人在申请再审前咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。
- 注意诉讼时效：在申请再审时，当事人应注意诉讼时效问题，确保在法定期限内提出再审申请。
若发现法院调解书中约定的利息高于法律规定的上限，当事人应及时采取行动，通过合法途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。