被告对伤残鉴定有异议时，鉴定费用并非直接由法院追回，而是需要根据具体情况来确定费用的承担方。以下是对此问题的详细分析：
一、伤残鉴定费用的承担原则
在劳动工伤案件中，伤残鉴定是确定劳动者伤残等级、进而确定赔偿金额的重要环节。关于伤残鉴定费用的承担，通常遵循以下原则：
谁主张、谁负担：一般情况下，提出伤残鉴定申请的一方（通常是劳动者或其代理人）需要预先支付鉴定费用。这是基于民事诉讼中“谁主张、谁举证”的原则，即提出主张的一方需要承担相应的举证责任，包括支付鉴定费用。
法院根据情况判定：如果被告（通常是用人单位或其保险公司）对伤残鉴定结果有异议，并申请重新鉴定，那么重新鉴定的费用承担问题，法院会根据具体情况进行判定。如果重新鉴定结果与原鉴定结果一致，或者被告未能提供充分证据证明原鉴定结果存在错误，那么法院可能会判定被告承担重新鉴定的费用。反之，如果重新鉴定结果改变了原鉴定结果，且原鉴定结果确实存在错误，那么法院可能会判定原鉴定费用的承担方（如劳动者）承担部分或全部重新鉴定费用，但这并非绝对，具体还需根据案件实际情况和法院的裁量权来确定。
二、被告对伤残鉴定有异议时的处理流程
当被告对伤残鉴定有异议时，通常需要按照以下流程处理：
提出异议：被告应在法定期限内（如收到鉴定报告后的一定期限内）向法院提出书面异议，并说明异议的理由和依据。
申请重新鉴定：如果被告认为原鉴定结果存在严重错误或不合理之处，可以向法院申请重新鉴定。法院在审查被告的申请后，会决定是否准许重新鉴定。
支付重新鉴定费用：如果法院准许重新鉴定，那么重新鉴定的费用通常需要由申请方（即被告）预先支付。但如前所述，最终费用的承担问题还需根据法院的判定来确定。
法院判定费用承担：在重新鉴定完成后，法院会根据鉴定结果和案件实际情况，判定鉴定费用的最终承担方。这可能包括原鉴定费用和重新鉴定费用的承担问题。
三、建议与注意事项
保留相关证据：无论是劳动者还是用人单位，在涉及伤残鉴定和费用承担问题时，都应妥善保留相关证据，如鉴定报告、缴费凭证、异议申请书等，以便在需要时提供证明。
及时咨询专业律师：由于伤残鉴定和费用承担问题涉及复杂的法律程序和专业知识，建议当事人在遇到此类问题时及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
尊重法院判定：无论最终鉴定费用的承担方是谁，都应尊重法院的判定结果，并按照判定结果履行相应的义务。
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