总包收取甲分包单位安全保证金是否合理，需分情况讨论：
若合同中有明确约定：
- 在建设工程领域，总包与分包单位之间的权利义务通常通过合同来明确。如果总包与甲分包单位在合同中明确约定了安全保证金的收取条款，包括保证金的金额、支付方式、退还条件等，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么总包收取安全保证金就是合理的。这种情况下，分包单位应当按照合同约定履行支付义务。
若合同中无明确约定，但存在行业惯例或地方性规定：
- 在某些地区或行业，可能存在收取安全保证金的惯例或地方性规定。如果总包能够证明收取安全保证金是符合当地行业惯例或地方性规定的，并且这种惯例或规定不违反法律法规的强制性规定，那么总包收取安全保证金也可能被认为是合理的。但这种情况下，总包需要承担举证责任，证明其收取保证金的合法性和合理性。
若合同中无约定，且无法律法规或行业惯例支持：
- 如果总包与甲分包单位在合同中没有约定安全保证金的收取，且没有法律法规或行业惯例作为支持，那么总包单方面收取安全保证金就可能缺乏合法依据。在这种情况下，分包单位有权拒绝支付，并可以寻求法律途径维护自己的合法权益。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国合同法》及相关法律法规，合同双方应当遵循公平、自愿、诚实信用的原则订立和履行合同。任何一方不得擅自变更或解除合同，也不得单方面增加对方的义务或减少自己的责任。因此，总包在收取安全保证金时，必须确保有合法的合同依据或法律法规支持。
- 建议：
- 对于总包单位而言，在收取安全保证金前，应当与分包单位进行充分沟通，并在合同中明确约定相关条款，以确保收取保证金的合法性和合理性。
- 对于分包单位而言，在签订合同时，应当仔细阅读合同条款，特别是关于安全保证金的约定。如果发现合同中存在不合理的条款或总包单位擅自收取保证金的情况，应当及时提出异议并寻求法律帮助。
可能的法律后果：
- 如果总包单位擅自收取安全保证金且无法提供合法依据，可能面临被分包单位起诉要求返还保证金的风险，并可能承担因违约而产生的赔偿责任。
- 如果分包单位拒绝支付无合法依据的安全保证金，总包单位不得以此为由拒绝履行合同义务或采取其他不当措施，否则可能构成违约并承担相应的法律责任。
综上所述，总包收取甲分包单位安全保证金是否合理，需根据合同约定、法律法规以及行业惯例等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。