中标后签订背离合同实质性内容的合同，通常会被认定为无效。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律依据与原则

1. 《中华人民共和国招标投标法》第四十六条：明确规定招标人和中标人应当按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，且不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。这一规定体现了招标投标活动的公开、公平、公正原则，以及维护市场秩序和当事人合法权益的立法目的。

2. 《关于适用〈中华人民共和国民法典〉合同编通则若干问题的解释》第十四条第三款：该条款规定，当事人就同一交易订立的多份合同均系真实意思表示，且不存在其他影响合同效力情形的，人民法院应当在查明各合同成立先后顺序和实际履行情况的基础上，认定合同内容是否发生变更。但法律、行政法规禁止变更合同内容的，人民法院应当认定合同的相应变更无效。这一规定为判断背离中标合同实质性内容的合同效力提供了明确的法律依据。

二、实务中的争议与观点

1. 主客观说：

   • 客观情况变化说：认为如果背离中标合同实质性内容是因为客观情况发生了变化，且这种变化是合同订立时无法预见的，那么另签合同可能被认定为有效。但这一观点在实务中存在争议，且需要具体案件具体分析。
   • 非客观情况变化说：认为如果并非因为客观情况发生变化的，另签合同应当为无效。这一观点更符合《招标投标法》的立法目的和原则。

2. 司法指导意见与裁判案例：

   • 认为有效的观点：体现在《全国民事审判工作会议纪要》、《北京市高级人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件若干疑难问题的解答》以及部分民事裁定等司法指导意见或者裁判案例中。但这些观点并未成为主流，且在实际操作中存在较大争议。
   • 认为无效的观点：体现在《全国法院民商事审判工作会议纪要》以及部分民事判决等司法指导意见或者裁判案例中。这些观点更符合《招标投标法》和《合同编通则解释》的规定，也是实务中的主流观点。

三、具体情形与后果

1. 依法必须进行招标的项目：

   • 对于依法必须进行招标的项目，只要当事人另行签订背离实质性内容的其他协议，该其他协议均应当被认定为无效。这是因为依法必须进行招标的项目通常涉及公共利益和重大经济利益，需要严格遵守招标投标程序和合同约定。

2. 非依法必须进行招标的项目：

   • 对于非依法必须进行招标的项目，虽然《招标投标法》的适用性可能有所减弱，但根据《合同编通则解释》的规定，只要背离了中标合同的实质性内容，且没有法律、行政法规的例外规定，另签合同同样应当被认定为无效。不过，在实务中，如果存在情势变更等特殊情形，法院可能会根据具体情况认定另签合同的效力。

3. 法律后果：

   • 背离中标合同实质性内容的合同被认定为无效后，当事人应当按照中标合同确定权利义务。如果因无效合同导致损失，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

四、建议与风险提示

1. 严格遵守招标投标程序：招标人和中标人应当严格按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。

2. 谨慎签订补充协议：如果因客观情况发生变化需要签订补充协议，应当确保补充协议的内容不违背中标合同的实质性条款，并尽量通过书面形式固定下来。

3. 及时咨询专业律师：在签订合同或处理合同纠纷时，建议及时咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性，并降低法律风险。

中标后签订背离合同实质性内容的合同通常会被认定为无效。在处理此类问题时，请务必遵守相关法律法规和司法解释的规定，并谨慎行事。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。