事业单位员工病假期间扣月度专项绩效工资是否合法，需结合具体情况与单位规定来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、政策依据与原则
事业单位员工的工资构成通常包括岗位工资、薪级工资、基础绩效、月度专项绩效、年度专项绩效及超额绩效等部分。关于病假期间工资的发放，主要依据《关于机关事业单位工作人员病假期间工资福利待遇有关问题的通知》等相关规定，并结合地方细则执行。绩效工资作为员工工作表现的一种奖励性待遇，其发放一般与员工实际出勤和工作表现挂钩。
二、病假时长与绩效工资发放
短期病假：
- 对于短期病假（如几天至几周），部分单位可能会根据员工实际出勤情况按比例扣除绩效工资，例如按病假天数扣除当日绩效工资。
- 也有单位在员工能通过线上等方式完成工作任务时，不扣除绩效工资，以保障员工权益和维持工作正常推进。
长期病假：
- 工作年限不满十年：连续病假超过两个月，从第三个月起可能停发绩效工资；连续病假超过六个月，从第七个月起岗位工资和薪级工资也可能按一定比例发放，绩效工资依然停发。
- 工作年限满十年：连续病假超过六个月，从第七个月起一般会按一定比例发放基本工资（岗位工资和薪级工资），绩效工资通常停发。
三、特殊情况处理
- 工伤病假：员工因工伤请病假，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，包括绩效工资也应正常发放。
- 重大疾病病假：对于患有癌症、精神病等重大疾病的员工，单位可能会给予特殊照顾，保留部分或全部绩效工资，以帮助员工度过难关。
四、合法性判断与建议
合法性判断：
- 病假扣绩效工资本身并不违法，因为绩效工资是基于员工工作表现的一种奖励性待遇。员工在病假期间未提供实际工作，单位根据规定扣除绩效工资是合理的。
- 但单位在扣除绩效工资时，需确保员工的基本工资（如岗位工资、薪级工资）不低于当地最低工资标准的80%，以符合《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》的相关规定。
建议：
- 员工在病假前应了解单位的具体规定和政策，以便在病假期间明确自己的权益。
- 如对单位扣除绩效工资的做法有异议，可先与单位人事部门沟通，了解具体政策依据和计算方式。
- 若沟通无果，员工可向上级主管部门反映情况，或通过劳动人事争议调解仲裁等法律途径解决争议。
总结来看，事业单位员工病假期间扣月度专项绩效工资是否合法，需结合病假时长、员工工作年限、单位规定及地方政策等多方面因素进行综合判断。员工在遇到此类问题时，应积极了解相关政策规定，维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。