结论：公司长期亏损的情况下，老板与公司签订无息借款合同是否符合独立交易原则，需结合具体交易条件、市场情况及税务合规性等多方面因素综合判断，不能一概而论。

一、独立交易原则的基本要求

独立交易原则（Arm’s Length Principle）要求关联方之间的交易应按照非关联方在相同或类似条件下的交易价格和条件进行。其核心在于确保交易价格的公允性，避免通过关联交易转移利润或逃避税收。

二、无息借款合同是否符合独立交易原则的分析

1. 交易条件是否公允

   • 市场利率对比：若市场上同类借款的利率为L%，而老板与公司签订的无息借款合同利率为0%，则需评估该0%利率是否符合市场常规。若市场上无息借款极为罕见，或借款方信用风险较高时仍提供无息借款，则可能不符合独立交易原则。
   • 借款期限与条件：还需考虑借款期限、还款方式、担保措施等交易条件是否与非关联方交易一致。例如，若非关联方借款需提供抵押或担保，而老板借款无需，则可能影响交易公允性。

2. 公司长期亏损的影响

   • 公司偿债能力：公司长期亏损可能影响其偿债能力，进而影响借款的合理性。若公司已资不抵债，仍向老板提供无息借款，可能被视为对老板的利益输送，不符合独立交易原则。
   • 利润转移嫌疑：若老板通过无息借款减少公司利息支出，进而增加公司利润（或减少亏损），而该利润最终通过分红等方式回流至老板，则可能构成利润转移，违反独立交易原则。

3. 税务合规性

   • 利息收入税务处理：若老板将资金借予公司，从税务角度，公司应支付利息并代扣代缴个人所得税（如适用）。无息借款可能导致税务风险，如被税务机关认定为隐匿收入或逃避纳税义务。
   • 关联交易申报：根据税法规定，关联方之间的交易需进行申报并接受税务机关的审查。无息借款合同需在税务申报中如实披露，并说明其合理性。

三、建议与风险提示

1. 完善交易条件：若决定签订无息借款合同，建议明确借款期限、还款方式、担保措施等交易条件，并确保其与非关联方交易一致。
2. 进行公允性评估：可委托第三方机构对借款利率进行评估，确保其符合市场常规和独立交易原则。
3. 加强税务合规：确保无息借款合同在税务申报中如实披露，并咨询税务机关或专业税务顾问，避免税务风险。
4. 考虑替代方案：若担心无息借款合同不符合独立交易原则，可考虑签订有息借款合同，并按照市场利率支付利息。

总结：公司长期亏损时，老板与公司签订无息借款合同是否符合独立交易原则，需结合交易条件、市场情况及税务合规性等多方面因素综合判断。建议在进行此类交易时，务必谨慎评估并咨询专业律师或税务顾问的意见，以确保交易的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。