在工程中标后，关于是先签合同还是先交农民工保证金的问题，需根据工程是否为招标工程来具体分析：
招标工程的情况：
- 先交保证金后签合同：对于招标工程，建设方通常会在招标书中明确要求投标人先交纳履约保证金（此处可理解为包含农民工保证金等类似性质的保证金），中标后再与中标方签订合同。这是招标流程中的常见做法，旨在确保中标方有足够的诚意和能力履行合同。
- 法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。同时，如果招标文件要求中标人提交履约保证金的，中标人应当提交。
非招标工程的情况：
- 先签合同后交保证金：对于非招标工程，双方应先签订合同，并在合同中明确约定履约保证金（包括农民工保证金）的相关条款，如金额、支付方式、退还条件等。合同签订后，再按照合同约定交纳保证金。
- 合同的重要性：合同是双方协商一致后形成的法律文件，用于明确各自的权利和义务。在非招标工程中，先签订合同可以确保双方在交纳保证金之前有明确的法律约束，从而降低潜在风险。
法律建议与风险提示：
- 明确合同条款：无论招标还是非招标工程，都应在合同中明确约定保证金的相关条款，以避免后续因约定不明而引发的纠纷。
- 遵守法律法规：在交纳保证金和签订合同的过程中，双方应严格遵守相关法律法规，确保所有行为都在法律框架内进行。
- 风险防控：对于中标方而言，如果中标后不履行签合同的义务，交的保证金可能无法退还。因此，在决定投标前，应充分评估自身能力和风险承受能力。
实际操作中的注意事项：
- 在涉及工程合作时，双方应首先进行充分的协商，并就工程范围、质量标准、工期、价款支付以及保证金等关键条款达成一致意见。
- 将这些条款详细写入合同中，并由双方签字盖章确认，形成具有法律效力的正式合同。
- 根据合同中的具体条款，按时足额交纳保证金，并确保保证金交纳的凭证和手续齐全。
如有任何关于工程中标后合同签订与保证金交纳的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。