竣工验收后发现未按图施工的追溯期问题，主要涉及的是工程质量责任和诉讼时效的相关规定。以下是我从不同角度为您进行的分析：
一、工程质量责任期限
合理使用年限内的责任：
- 根据《建设工程质量管理条例》及相关规定，建设工程在合理使用年限内，如果因施工原因造成质量问题，施工单位应当承担相应的修复、赔偿等责任。这里的“合理使用年限”通常根据工程类型和设计要求确定，如民用建筑主体结构的设计使用年限可能为50年或更长。
- 若在合理使用年限内发现未按图施工的问题，施工单位仍需承担责任。这意味着，即使工程已经竣工验收多年，只要仍在合理使用年限内，且问题是由施工不当造成的，业主或使用方都有权要求施工单位进行修复或赔偿。
保修期内的责任：
- 除了合理使用年限外，建设工程还有明确的保修期规定。根据《建设工程质量管理条例》，不同部位的保修期不同，如基础设施工程、房屋建筑的地基基础工程和主体结构工程为设计文件规定的该工程的合理使用年限；屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏为5年；供热与供冷系统为2个采暖期、供冷期；电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程为2年等。
- 在保修期内，施工单位对因施工原因造成的质量问题负有免费修复的义务。因此，如果竣工验收后发现未按图施工的问题，且该问题在保修期内，业主或使用方可以要求施工单位免费进行修复。
二、诉讼时效期限
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果业主或使用方发现未按图施工的问题，并希望通过法律途径解决，他们需要在知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起三年内提起诉讼。
- 然而，需要注意的是，诉讼时效的起算点可能因具体情况而有所不同。例如，如果问题在竣工验收时并未被发现，而是在后续使用过程中逐渐显现，那么诉讼时效的起算点可能会从发现问题之时开始计算。
最长诉讼时效：
- 除了三年的一般诉讼时效外，还存在最长诉讼时效的规定。根据《中华人民共和国民法典》，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
- 这意味着，即使超过了三年的诉讼时效，只要未超过二十年，且存在特殊情况（如权利人因客观原因无法及时行使权利），业主或使用方仍有可能通过法律途径维护自己的权益。
三、实际操作建议
及时取证：
- 一旦发现未按图施工的问题，业主或使用方应及时取证，包括拍摄现场照片、收集相关施工图纸和验收记录等。这些证据将有助于后续的法律纠纷解决。
与施工单位协商：
- 在发现问题后，业主或使用方可以尝试与施工单位进行协商，要求其进行修复或赔偿。如果协商成功，可以节省时间和成本。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，业主或使用方可以寻求法律援助，通过法律途径解决纠纷。在此过程中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
综上所述，竣工验收后发现未按图施工的追溯期问题涉及工程质量责任期限和诉讼时效期限两个方面。业主或使用方应根据具体情况判断责任期限和诉讼时效的起算点，并及时采取行动维护自己的权益。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。