针对您提出的“二年分居起诉一方不同意怎么办”的问题，这确实是一个在婚姻法律中较为常见且需要细致处理的情境。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律基础与原则
首先，我们需要明确的是，根据《民法典》的相关规定，如果因感情不和分居满二年，且经过法院调解无效，那么法院应当准予离婚。这是法律对于因感情破裂导致长期分居情况的一种明确处理原则。
二、处理步骤与建议
收集分居证据：
- 在起诉离婚前，您需要收集充分的证据来证明您与对方因感情不和已经分居满二年。这些证据可以包括但不限于：分居协议（如果有的话）、租房合同、居委会或物业的居住证明、双方的通信记录（如短信、邮件等，能体现分居期间无感情交流或交流极少的情况）、证人证言（如邻居、朋友等能证明分居事实的人）等。
向法院提起诉讼：
- 准备好起诉状和相关证据后，向有管辖权的法院（通常是被告住所地或经常居住地的法院）提起离婚诉讼。
法院调解与审理：
- 法院在受理案件后，会先进行调解，试图通过协商的方式解决纠纷。如果调解不成，法院会进入审理阶段。
- 在审理过程中，您需要向法院清晰阐述分居期间双方的生活状态及感情状况，包括是否有过交流互动、感情是否有改善等，以支撑您的离婚诉求。
多次起诉的可能性：
- 如果第一次起诉离婚未获准许，不要灰心。根据法律规定，您可以在判决生效后六个月再次起诉。多次起诉可以增加判决离婚的可能性，因为法院会综合考虑分居时间、夫妻感情等多种因素作出判决。
三、注意事项与风险提示
- 证据的真实性与完整性：您提供的证据必须真实、完整，能够充分证明分居事实及分居时间。如果证据不足或存在瑕疵，可能会影响法院的判决结果。
- 法律程序的遵循：在整个诉讼过程中，您需要严格遵循法律程序，按时提交相关材料，参加庭审等。如果违反法律程序，可能会导致诉讼失败。
- 专业法律指导：由于离婚诉讼涉及复杂的法律问题和情感纠葛，建议您在诉讼过程中寻求专业律师的法律指导。律师可以帮助您更好地准备证据、阐述诉求，并维护您的合法权益。
四、其他相关问题的考虑
- 财产分割：如果对方不同意离婚，还可能在财产分割方面产生纠纷。您需要提前了解夫妻共同财产的认定和分配原则，以便在诉讼过程中能够合理主张自己的权益。
- 子女抚养权：如果双方有子女，子女抚养权的归属也可能成为争执点。您需要提前考虑子女的成长环境、教育需求等因素，以便在诉讼过程中能够争取到最有利的抚养权安排。
综上所述，二年分居起诉一方不同意离婚的情况下，您需要通过收集充分证据、向法院提起诉讼、参与调解与审理等步骤来维护自己的权益。同时，也需要注意证据的真实性与完整性、法律程序的遵循以及寻求专业法律指导等问题。希望这些建议能够对您有所帮助。