关于您提出的“分居满两年去起诉法院怎么判”的问题，这确实是一个涉及法律程序和判决依据的复杂问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、法律程序概述
当夫妻双方分居满两年，并希望通过起诉方式离婚时，需要遵循一系列法律程序。这包括确认管辖法院、准备诉讼材料、立案、送达与答辩、开庭审理以及最终的判决。
二、分居满两年的法律意义
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，“因感情不和分居满二年”是认定夫妻感情确已破裂的情形之一。这意味着，如果夫妻双方确实因为感情不和而连续分居满两年，且没有和好的迹象，那么法院在审理离婚案件时，会将这一因素作为判断夫妻感情是否破裂的重要依据。
三、法院判决的依据
分居原因：
- 法院会审查分居是否确实因为感情不和，而非其他原因（如工作、学习等）导致的两地分居。
分居时间：
- 需要连续分居满两年，且该时间是持续不间断的。如果期间有短暂的和好或共同生活，分居时间的计算可能会受到影响。
证据材料：
- 当事人需要提供能够证明分居事实的证据，如租房合同、居住证明、聊天记录等。这些证据需要能够清晰地证明双方因感情不和而分居的事实。
四、可能的判决结果
判决离婚：
- 如果能够提供充分证据证明是因感情不和分居满两年，且经法院调解无效，法院一般会认为夫妻感情确已破裂，从而判决离婚。
不予离婚：
- 若无法提供足够证据证明分居是因感情不和导致，或者分居时间未达到法定要求，法院可能不会判决离婚。
五、特殊情况考虑
存在过错行为：
- 如果在分居期间，一方存在重婚、与他人同居、实施家庭暴力等重大过错行为，即使分居未满两年，法院也可能判决离婚，并在财产分割等方面对无过错方予以照顾。
涉及子女抚养和财产分割问题：
- 法院判决离婚时，还会一并处理子女抚养和财产分割等问题。对于子女的抚养权归属，会根据子女的年龄、性别、父母双方的抚养能力和条件等因素综合考虑；财产分割则会遵循男女平等、照顾子女和女方权益的原则进行。
六、建议与注意事项
准备充分证据：
- 在起诉前，务必准备充分的证据来证明分居事实和感情破裂的原因。
寻求专业帮助：
- 如果对法律程序不熟悉，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保护。
保持冷静与理性：
- 离婚诉讼可能涉及复杂的情感和法律问题，保持冷静与理性对于解决问题至关重要。
综上所述，分居满两年去起诉离婚时，法院的判决会综合考虑多个因素。为了确保自身权益得到充分保护，建议您在起诉前准备充分的证据，并寻求专业律师的帮助。